Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVDP53602 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVDP53602 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVDP53602 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MVDP53602 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MVDP53602 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVDP53602 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVDP53602 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVDP53602 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVDP53602 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVDP53602 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVDP53602 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVDP53602 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVDP53602 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MVDP53602 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVDP53602 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVDP53602 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVDP53602 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVDP53602 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MVDP53602 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVDP53602 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVDP53602 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVDP53602 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVDP53602 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVDP53602 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVDP53602 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVDP53602 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVDP53602 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVDP53602 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVDP53602 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVDP53602 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVDP53602 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MVDP53602 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MVDP53602 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVDP53602 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVDP53602 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVDP53602 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVDP53602 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MVDP53602 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MVDP53602 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MVDP53602 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MVDP53602 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MVDP53602 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MVDP53602 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MVDP53602 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MVDP53602 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MVDP53602 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MVDP53602 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MVDP53602 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
MVDP53602 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MVDP53602 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MVDP53602 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms