Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FLT4P35916 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FLT4P35916 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FLT4P35916 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FLT4P35916 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FLT4P35916 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FLT4P35916 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FLT4P35916 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FLT4P35916 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FLT4P35916 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FLT4P35916 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FLT4P35916 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FLT4P35916 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FLT4P35916 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FLT4P35916 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FLT4P35916 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FLT4P35916 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FLT4P35916 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FLT4P35916 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FLT4P35916 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FLT4P35916 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FLT4P35916 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FLT4P35916 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FLT4P35916 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FLT4P35916 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FLT4P35916 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FLT4P35916 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FLT4P35916 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FLT4P35916 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FLT4P35916 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FLT4P35916 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FLT4P35916 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FLT4P35916 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FLT4P35916 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FLT4P35916 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FLT4P35916 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FLT4P35916 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FLT4P35916 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FLT4P35916 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FLT4P35916 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FLT4P35916 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FLT4P35916 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FLT4P35916 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FLT4P35916 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FLT4P35916 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FLT4P35916 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FLT4P35916 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FLT4P35916 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FLT4P35916 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FLT4P35916 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FLT4P35916 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FLT4P35916 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FLT4P35916 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FLT4P35916 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FLT4P35916 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FLT4P35916 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FLT4P35916 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FLT4P35916 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FLT4P35916 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FLT4P35916 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FLT4P35916 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FLT4P35916 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FLT4P35916 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FLT4P35916 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FLT4P35916 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FLT4P35916 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FLT4P35916 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FLT4P35916 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FLT4P35916 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FLT4P35916 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
FLT4P35916 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
FLT4P35916 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FLT4P35916 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FLT4P35916 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FLT4P35916 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FLT4P35916 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FLT4P35916 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FLT4P35916 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FLT4P35916 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FLT4P35916 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FLT4P35916 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FLT4P35916 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FLT4P35916 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FLT4P35916 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FLT4P35916 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FLT4P35916 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FLT4P35916 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FLT4P35916 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FLT4P35916 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FLT4P35916 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FLT4P35916 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FLT4P35916 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FLT4P35916 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FLT4P35916 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FLT4P35916 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FLT4P35916 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FLT4P35916 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FLT4P35916 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FLT4P35916 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FLT4P35916 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms