Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX2P28328 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX2P28328 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX2P28328 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX2P28328 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX2P28328 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX2P28328 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX2P28328 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX2P28328 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX2P28328 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX2P28328 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX2P28328 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX2P28328 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX2P28328 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX2P28328 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX2P28328 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX2P28328 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX2P28328 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX2P28328 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX2P28328 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX2P28328 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX2P28328 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX2P28328 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX2P28328 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX2P28328 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX2P28328 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX2P28328 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX2P28328 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX2P28328 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX2P28328 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX2P28328 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX2P28328 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX2P28328 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX2P28328 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX2P28328 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX2P28328 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX2P28328 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX2P28328 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX2P28328 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX2P28328 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX2P28328 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX2P28328 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX2P28328 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX2P28328 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX2P28328 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX2P28328 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX2P28328 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX2P28328 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX2P28328 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX2P28328 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX2P28328 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX2P28328 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX2P28328 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX2P28328 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX2P28328 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX2P28328 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX2P28328 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX2P28328 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX2P28328 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX2P28328 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX2P28328 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX2P28328 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX2P28328 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX2P28328 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX2P28328 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX2P28328 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX2P28328 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX2P28328 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX2P28328 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX2P28328 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX2P28328 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PEX2P28328 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX2P28328 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX2P28328 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX2P28328 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX2P28328 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX2P28328 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX2P28328 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX2P28328 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX2P28328 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX2P28328 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX2P28328 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX2P28328 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX2P28328 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX2P28328 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX2P28328 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX2P28328 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX2P28328 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX2P28328 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX2P28328 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX2P28328 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX2P28328 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX2P28328 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX2P28328 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX2P28328 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX2P28328 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX2P28328 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX2P28328 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX2P28328 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX2P28328 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms