Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD3P28288 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms