Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALB2P22676 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CALB2P22676 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALB2P22676 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CALB2P22676 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CALB2P22676 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CALB2P22676 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CALB2P22676 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CALB2P22676 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CALB2P22676 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CALB2P22676 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CALB2P22676 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALB2P22676 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALB2P22676 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALB2P22676 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALB2P22676 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CALB2P22676 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALB2P22676 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALB2P22676 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALB2P22676 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALB2P22676 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALB2P22676 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALB2P22676 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALB2P22676 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CALB2P22676 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALB2P22676 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALB2P22676 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALB2P22676 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALB2P22676 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALB2P22676 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALB2P22676 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALB2P22676 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALB2P22676 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALB2P22676 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALB2P22676 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALB2P22676 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CALB2P22676 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALB2P22676 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALB2P22676 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALB2P22676 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALB2P22676 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALB2P22676 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALB2P22676 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALB2P22676 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALB2P22676 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALB2P22676 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALB2P22676 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALB2P22676 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALB2P22676 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALB2P22676 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALB2P22676 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALB2P22676 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALB2P22676 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALB2P22676 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALB2P22676 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALB2P22676 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALB2P22676 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALB2P22676 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALB2P22676 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALB2P22676 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALB2P22676 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALB2P22676 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALB2P22676 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALB2P22676 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALB2P22676 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALB2P22676 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALB2P22676 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALB2P22676 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALB2P22676 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALB2P22676 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALB2P22676 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALB2P22676 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALB2P22676 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALB2P22676 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALB2P22676 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALB2P22676 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALB2P22676 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALB2P22676 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALB2P22676 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALB2P22676 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALB2P22676 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CALB2P22676 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALB2P22676 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALB2P22676 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALB2P22676 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALB2P22676 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALB2P22676 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALB2P22676 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALB2P22676 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALB2P22676 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALB2P22676 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALB2P22676 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALB2P22676 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALB2P22676 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALB2P22676 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CALB2P22676 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALB2P22676 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CALB2P22676 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALB2P22676 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALB2P22676 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms