Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCNA2P20248 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms