Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 AC068985.1-201ENST00000463297 703 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 AC022087.1-201ENST00000558372 612 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 AC009118.3-201ENST00000622896 873 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXB3P14651 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms