Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFMP07197 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFMP07197 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFMP07197 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFMP07197 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFMP07197 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFMP07197 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFMP07197 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFMP07197 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFMP07197 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFMP07197 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFMP07197 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFMP07197 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFMP07197 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFMP07197 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFMP07197 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFMP07197 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFMP07197 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFMP07197 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFMP07197 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFMP07197 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFMP07197 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFMP07197 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFMP07197 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFMP07197 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFMP07197 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFMP07197 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFMP07197 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFMP07197 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFMP07197 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFMP07197 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFMP07197 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFMP07197 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFMP07197 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFMP07197 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFMP07197 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFMP07197 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFMP07197 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFMP07197 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFMP07197 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEFMP07197 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFMP07197 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFMP07197 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFMP07197 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFMP07197 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFMP07197 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFMP07197 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFMP07197 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFMP07197 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFMP07197 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFMP07197 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFMP07197 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFMP07197 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFMP07197 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFMP07197 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFMP07197 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFMP07197 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFMP07197 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFMP07197 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFMP07197 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFMP07197 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFMP07197 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFMP07197 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFMP07197 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFMP07197 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFMP07197 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFMP07197 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFMP07197 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFMP07197 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFMP07197 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFMP07197 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFMP07197 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFMP07197 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFMP07197 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFMP07197 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFMP07197 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEFMP07197 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEFMP07197 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEFMP07197 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEFMP07197 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEFMP07197 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEFMP07197 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEFMP07197 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEFMP07197 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEFMP07197 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEFMP07197 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEFMP07197 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEFMP07197 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NEFMP07197 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEFMP07197 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEFMP07197 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEFMP07197 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEFMP07197 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEFMP07197 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEFMP07197 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEFMP07197 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEFMP07197 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFMP07197 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFMP07197 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEFMP07197 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms