Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIOO75962 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIOO75962 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIOO75962 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIOO75962 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIOO75962 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIOO75962 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIOO75962 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIOO75962 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRIOO75962 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIOO75962 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIOO75962 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIOO75962 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIOO75962 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIOO75962 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIOO75962 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIOO75962 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIOO75962 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIOO75962 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIOO75962 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIOO75962 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIOO75962 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIOO75962 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIOO75962 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIOO75962 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIOO75962 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRIOO75962 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRIOO75962 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIOO75962 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIOO75962 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIOO75962 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIOO75962 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIOO75962 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIOO75962 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIOO75962 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIOO75962 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIOO75962 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIOO75962 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIOO75962 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIOO75962 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIOO75962 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIOO75962 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIOO75962 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIOO75962 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIOO75962 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIOO75962 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIOO75962 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIOO75962 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIOO75962 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIOO75962 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIOO75962 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIOO75962 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRIOO75962 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIOO75962 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIOO75962 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIOO75962 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIOO75962 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIOO75962 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIOO75962 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIOO75962 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIOO75962 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIOO75962 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIOO75962 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIOO75962 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIOO75962 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIOO75962 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIOO75962 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIOO75962 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIOO75962 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIOO75962 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIOO75962 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIOO75962 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIOO75962 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIOO75962 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIOO75962 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIOO75962 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIOO75962 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIOO75962 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIOO75962 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIOO75962 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIOO75962 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIOO75962 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIOO75962 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIOO75962 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIOO75962 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIOO75962 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIOO75962 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIOO75962 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIOO75962 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIOO75962 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIOO75962 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIOO75962 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIOO75962 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIOO75962 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIOO75962 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIOO75962 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIOO75962 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIOO75962 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIOO75962 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIOO75962 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms