Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKAP2O75563 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms