Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
J3QR89 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
J3QR89 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
J3QR89 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
J3QR89 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
J3QR89 REV3L-201ENST00000358835 10815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
J3QR89 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
J3QR89 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
J3QR89 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
J3QR89 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
J3QR89 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
J3QR89 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
J3QR89 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
J3QR89 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
J3QR89 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
J3QR89 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
J3QR89 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
J3QR89 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
J3QR89 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
J3QR89 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
J3QR89 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
J3QR89 OTOF-204ENST00000402415 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
J3QR89 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
J3QR89 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
J3QR89 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
J3QR89 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
J3QR89 SLIT2-204ENST00000504154 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
J3QR89 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
J3QR89 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
J3QR89 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
J3QR89 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 PCDHGA6-201ENST00000517434 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 PBX1-203ENST00000420696 6636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 POLR1B-216ENST00000537335 4961 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
J3QR89 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
J3QR89 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
J3QR89 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
J3QR89 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
J3QR89 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
J3QR89 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
J3QR89 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
J3QR89 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
J3QR89 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
J3QR89 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
J3QR89 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
J3QR89 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
J3QR89 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
J3QR89 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms