Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GJA3Q9Y6H8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GJA3Q9Y6H8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GJA3Q9Y6H8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GJA3Q9Y6H8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GJA3Q9Y6H8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
GJA3Q9Y6H8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GJA3Q9Y6H8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GJA3Q9Y6H8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
GJA3Q9Y6H8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GJA3Q9Y6H8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GJA3Q9Y6H8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GJA3Q9Y6H8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GJA3Q9Y6H8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GJA3Q9Y6H8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GJA3Q9Y6H8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GJA3Q9Y6H8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GJA3Q9Y6H8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GJA3Q9Y6H8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GJA3Q9Y6H8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GJA3Q9Y6H8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GJA3Q9Y6H8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GJA3Q9Y6H8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GJA3Q9Y6H8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GJA3Q9Y6H8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GJA3Q9Y6H8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GJA3Q9Y6H8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
GJA3Q9Y6H8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GJA3Q9Y6H8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GJA3Q9Y6H8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GJA3Q9Y6H8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GJA3Q9Y6H8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GJA3Q9Y6H8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
GJA3Q9Y6H8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GJA3Q9Y6H8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GJA3Q9Y6H8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GJA3Q9Y6H8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
GJA3Q9Y6H8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GJA3Q9Y6H8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GJA3Q9Y6H8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GJA3Q9Y6H8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GJA3Q9Y6H8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GJA3Q9Y6H8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GJA3Q9Y6H8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
GJA3Q9Y6H8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GJA3Q9Y6H8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GJA3Q9Y6H8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GJA3Q9Y6H8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GJA3Q9Y6H8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GJA3Q9Y6H8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GJA3Q9Y6H8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GJA3Q9Y6H8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
GJA3Q9Y6H8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GJA3Q9Y6H8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GJA3Q9Y6H8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GJA3Q9Y6H8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GJA3Q9Y6H8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GJA3Q9Y6H8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GJA3Q9Y6H8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GJA3Q9Y6H8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GJA3Q9Y6H8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GJA3Q9Y6H8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GJA3Q9Y6H8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
GJA3Q9Y6H8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GJA3Q9Y6H8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GJA3Q9Y6H8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GJA3Q9Y6H8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GJA3Q9Y6H8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GJA3Q9Y6H8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GJA3Q9Y6H8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GJA3Q9Y6H8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GJA3Q9Y6H8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GJA3Q9Y6H8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
GJA3Q9Y6H8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GJA3Q9Y6H8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GJA3Q9Y6H8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GJA3Q9Y6H8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GJA3Q9Y6H8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GJA3Q9Y6H8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
GJA3Q9Y6H8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
GJA3Q9Y6H8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
GJA3Q9Y6H8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
GJA3Q9Y6H8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GJA3Q9Y6H8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GJA3Q9Y6H8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GJA3Q9Y6H8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GJA3Q9Y6H8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GJA3Q9Y6H8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GJA3Q9Y6H8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GJA3Q9Y6H8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
GJA3Q9Y6H8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GJA3Q9Y6H8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GJA3Q9Y6H8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GJA3Q9Y6H8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GJA3Q9Y6H8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GJA3Q9Y6H8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GJA3Q9Y6H8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GJA3Q9Y6H8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
GJA3Q9Y6H8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
GJA3Q9Y6H8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms