Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX10Q9Y5X0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX10Q9Y5X0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX10Q9Y5X0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX10Q9Y5X0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX10Q9Y5X0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX10Q9Y5X0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX10Q9Y5X0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX10Q9Y5X0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX10Q9Y5X0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX10Q9Y5X0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX10Q9Y5X0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX10Q9Y5X0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX10Q9Y5X0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX10Q9Y5X0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX10Q9Y5X0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX10Q9Y5X0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX10Q9Y5X0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX10Q9Y5X0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX10Q9Y5X0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX10Q9Y5X0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX10Q9Y5X0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX10Q9Y5X0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX10Q9Y5X0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX10Q9Y5X0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX10Q9Y5X0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX10Q9Y5X0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX10Q9Y5X0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX10Q9Y5X0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX10Q9Y5X0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX10Q9Y5X0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX10Q9Y5X0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX10Q9Y5X0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX10Q9Y5X0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX10Q9Y5X0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX10Q9Y5X0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX10Q9Y5X0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX10Q9Y5X0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX10Q9Y5X0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX10Q9Y5X0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX10Q9Y5X0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX10Q9Y5X0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX10Q9Y5X0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX10Q9Y5X0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX10Q9Y5X0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX10Q9Y5X0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX10Q9Y5X0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX10Q9Y5X0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX10Q9Y5X0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX10Q9Y5X0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX10Q9Y5X0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX10Q9Y5X0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX10Q9Y5X0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX10Q9Y5X0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX10Q9Y5X0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX10Q9Y5X0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX10Q9Y5X0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX10Q9Y5X0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX10Q9Y5X0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX10Q9Y5X0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX10Q9Y5X0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX10Q9Y5X0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX10Q9Y5X0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX10Q9Y5X0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SNX10Q9Y5X0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX10Q9Y5X0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX10Q9Y5X0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX10Q9Y5X0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX10Q9Y5X0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX10Q9Y5X0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX10Q9Y5X0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX10Q9Y5X0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX10Q9Y5X0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX10Q9Y5X0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX10Q9Y5X0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX10Q9Y5X0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX10Q9Y5X0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX10Q9Y5X0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX10Q9Y5X0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX10Q9Y5X0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX10Q9Y5X0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX10Q9Y5X0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX10Q9Y5X0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX10Q9Y5X0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX10Q9Y5X0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX10Q9Y5X0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX10Q9Y5X0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX10Q9Y5X0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX10Q9Y5X0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX10Q9Y5X0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX10Q9Y5X0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX10Q9Y5X0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX10Q9Y5X0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX10Q9Y5X0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX10Q9Y5X0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX10Q9Y5X0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX10Q9Y5X0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX10Q9Y5X0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX10Q9Y5X0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX10Q9Y5X0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms