Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP15Q9Y4E8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP15Q9Y4E8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP15Q9Y4E8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP15Q9Y4E8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP15Q9Y4E8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP15Q9Y4E8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP15Q9Y4E8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP15Q9Y4E8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP15Q9Y4E8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
USP15Q9Y4E8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP15Q9Y4E8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP15Q9Y4E8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP15Q9Y4E8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP15Q9Y4E8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP15Q9Y4E8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP15Q9Y4E8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP15Q9Y4E8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP15Q9Y4E8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP15Q9Y4E8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP15Q9Y4E8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP15Q9Y4E8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP15Q9Y4E8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP15Q9Y4E8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP15Q9Y4E8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
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