Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP15Q9Y4E8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP15Q9Y4E8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP15Q9Y4E8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP15Q9Y4E8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP15Q9Y4E8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP15Q9Y4E8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP15Q9Y4E8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP15Q9Y4E8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP15Q9Y4E8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP15Q9Y4E8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP15Q9Y4E8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
USP15Q9Y4E8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP15Q9Y4E8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP15Q9Y4E8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP15Q9Y4E8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP15Q9Y4E8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP15Q9Y4E8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP15Q9Y4E8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP15Q9Y4E8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP15Q9Y4E8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP15Q9Y4E8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP15Q9Y4E8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP15Q9Y4E8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP15Q9Y4E8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP15Q9Y4E8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP15Q9Y4E8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP15Q9Y4E8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms