Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E1

WASHC2C, WASH complex subunit 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2CQ9Y4E1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
WASHC2CQ9Y4E1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
WASHC2CQ9Y4E1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
WASHC2CQ9Y4E1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
WASHC2CQ9Y4E1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
WASHC2CQ9Y4E1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
WASHC2CQ9Y4E1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC35.83■■■■□ 3.33
WASHC2CQ9Y4E1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
WASHC2CQ9Y4E1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
WASHC2CQ9Y4E1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
WASHC2CQ9Y4E1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
WASHC2CQ9Y4E1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
WASHC2CQ9Y4E1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
WASHC2CQ9Y4E1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
WASHC2CQ9Y4E1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
WASHC2CQ9Y4E1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
WASHC2CQ9Y4E1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC35.8■■■■□ 3.32
WASHC2CQ9Y4E1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
WASHC2CQ9Y4E1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
WASHC2CQ9Y4E1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
WASHC2CQ9Y4E1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
WASHC2CQ9Y4E1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
WASHC2CQ9Y4E1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
WASHC2CQ9Y4E1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
WASHC2CQ9Y4E1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
WASHC2CQ9Y4E1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
WASHC2CQ9Y4E1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
WASHC2CQ9Y4E1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
WASHC2CQ9Y4E1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
WASHC2CQ9Y4E1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
WASHC2CQ9Y4E1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
WASHC2CQ9Y4E1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
WASHC2CQ9Y4E1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.31
WASHC2CQ9Y4E1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
WASHC2CQ9Y4E1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
WASHC2CQ9Y4E1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC35.75■■■■□ 3.31
WASHC2CQ9Y4E1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
WASHC2CQ9Y4E1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
WASHC2CQ9Y4E1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
WASHC2CQ9Y4E1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
WASHC2CQ9Y4E1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
WASHC2CQ9Y4E1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
WASHC2CQ9Y4E1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
WASHC2CQ9Y4E1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
WASHC2CQ9Y4E1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
WASHC2CQ9Y4E1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
WASHC2CQ9Y4E1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
WASHC2CQ9Y4E1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
WASHC2CQ9Y4E1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
WASHC2CQ9Y4E1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
WASHC2CQ9Y4E1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
WASHC2CQ9Y4E1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
WASHC2CQ9Y4E1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC35.72■■■■□ 3.31
WASHC2CQ9Y4E1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
WASHC2CQ9Y4E1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
WASHC2CQ9Y4E1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
WASHC2CQ9Y4E1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
WASHC2CQ9Y4E1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
WASHC2CQ9Y4E1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
WASHC2CQ9Y4E1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
WASHC2CQ9Y4E1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
WASHC2CQ9Y4E1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
WASHC2CQ9Y4E1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
WASHC2CQ9Y4E1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
WASHC2CQ9Y4E1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
WASHC2CQ9Y4E1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
WASHC2CQ9Y4E1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
WASHC2CQ9Y4E1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
WASHC2CQ9Y4E1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
WASHC2CQ9Y4E1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
WASHC2CQ9Y4E1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
WASHC2CQ9Y4E1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
WASHC2CQ9Y4E1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC35.66■■■■□ 3.3
WASHC2CQ9Y4E1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
WASHC2CQ9Y4E1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
WASHC2CQ9Y4E1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
WASHC2CQ9Y4E1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
WASHC2CQ9Y4E1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
WASHC2CQ9Y4E1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
WASHC2CQ9Y4E1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC35.63■■■■□ 3.29
WASHC2CQ9Y4E1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
WASHC2CQ9Y4E1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
WASHC2CQ9Y4E1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
WASHC2CQ9Y4E1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
WASHC2CQ9Y4E1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
WASHC2CQ9Y4E1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
WASHC2CQ9Y4E1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
WASHC2CQ9Y4E1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
WASHC2CQ9Y4E1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
WASHC2CQ9Y4E1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
WASHC2CQ9Y4E1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
WASHC2CQ9Y4E1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
WASHC2CQ9Y4E1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
WASHC2CQ9Y4E1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
WASHC2CQ9Y4E1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
WASHC2CQ9Y4E1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
WASHC2CQ9Y4E1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
WASHC2CQ9Y4E1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms