Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B5

MTCL1, Microtubule cross-linking factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCL1Q9Y4B5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTCL1Q9Y4B5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTCL1Q9Y4B5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTCL1Q9Y4B5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MTCL1Q9Y4B5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTCL1Q9Y4B5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTCL1Q9Y4B5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTCL1Q9Y4B5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTCL1Q9Y4B5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTCL1Q9Y4B5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTCL1Q9Y4B5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MTCL1Q9Y4B5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTCL1Q9Y4B5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTCL1Q9Y4B5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTCL1Q9Y4B5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTCL1Q9Y4B5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTCL1Q9Y4B5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTCL1Q9Y4B5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTCL1Q9Y4B5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTCL1Q9Y4B5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTCL1Q9Y4B5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTCL1Q9Y4B5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MTCL1Q9Y4B5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTCL1Q9Y4B5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTCL1Q9Y4B5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MTCL1Q9Y4B5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MTCL1Q9Y4B5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTCL1Q9Y4B5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTCL1Q9Y4B5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MTCL1Q9Y4B5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTCL1Q9Y4B5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTCL1Q9Y4B5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTCL1Q9Y4B5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTCL1Q9Y4B5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTCL1Q9Y4B5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MTCL1Q9Y4B5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MTCL1Q9Y4B5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTCL1Q9Y4B5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MTCL1Q9Y4B5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MTCL1Q9Y4B5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTCL1Q9Y4B5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTCL1Q9Y4B5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTCL1Q9Y4B5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTCL1Q9Y4B5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTCL1Q9Y4B5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTCL1Q9Y4B5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTCL1Q9Y4B5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTCL1Q9Y4B5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTCL1Q9Y4B5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTCL1Q9Y4B5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTCL1Q9Y4B5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTCL1Q9Y4B5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MTCL1Q9Y4B5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTCL1Q9Y4B5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTCL1Q9Y4B5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTCL1Q9Y4B5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTCL1Q9Y4B5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTCL1Q9Y4B5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MTCL1Q9Y4B5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTCL1Q9Y4B5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTCL1Q9Y4B5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTCL1Q9Y4B5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTCL1Q9Y4B5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTCL1Q9Y4B5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTCL1Q9Y4B5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTCL1Q9Y4B5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTCL1Q9Y4B5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTCL1Q9Y4B5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTCL1Q9Y4B5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTCL1Q9Y4B5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTCL1Q9Y4B5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTCL1Q9Y4B5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTCL1Q9Y4B5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTCL1Q9Y4B5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MTCL1Q9Y4B5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTCL1Q9Y4B5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTCL1Q9Y4B5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTCL1Q9Y4B5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTCL1Q9Y4B5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTCL1Q9Y4B5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTCL1Q9Y4B5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTCL1Q9Y4B5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTCL1Q9Y4B5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTCL1Q9Y4B5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTCL1Q9Y4B5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTCL1Q9Y4B5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTCL1Q9Y4B5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTCL1Q9Y4B5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTCL1Q9Y4B5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTCL1Q9Y4B5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTCL1Q9Y4B5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTCL1Q9Y4B5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTCL1Q9Y4B5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTCL1Q9Y4B5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTCL1Q9Y4B5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTCL1Q9Y4B5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MTCL1Q9Y4B5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTCL1Q9Y4B5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTCL1Q9Y4B5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTCL1Q9Y4B5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms