Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDGFL3Q9Y3E1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDGFL3Q9Y3E1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDGFL3Q9Y3E1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDGFL3Q9Y3E1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HDGFL3Q9Y3E1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDGFL3Q9Y3E1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDGFL3Q9Y3E1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDGFL3Q9Y3E1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDGFL3Q9Y3E1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDGFL3Q9Y3E1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HDGFL3Q9Y3E1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDGFL3Q9Y3E1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDGFL3Q9Y3E1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HDGFL3Q9Y3E1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDGFL3Q9Y3E1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HDGFL3Q9Y3E1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDGFL3Q9Y3E1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDGFL3Q9Y3E1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDGFL3Q9Y3E1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDGFL3Q9Y3E1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDGFL3Q9Y3E1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDGFL3Q9Y3E1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDGFL3Q9Y3E1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HDGFL3Q9Y3E1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDGFL3Q9Y3E1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDGFL3Q9Y3E1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HDGFL3Q9Y3E1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDGFL3Q9Y3E1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDGFL3Q9Y3E1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDGFL3Q9Y3E1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDGFL3Q9Y3E1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HDGFL3Q9Y3E1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDGFL3Q9Y3E1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HDGFL3Q9Y3E1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDGFL3Q9Y3E1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDGFL3Q9Y3E1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDGFL3Q9Y3E1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HDGFL3Q9Y3E1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDGFL3Q9Y3E1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDGFL3Q9Y3E1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDGFL3Q9Y3E1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDGFL3Q9Y3E1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDGFL3Q9Y3E1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HDGFL3Q9Y3E1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDGFL3Q9Y3E1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDGFL3Q9Y3E1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDGFL3Q9Y3E1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDGFL3Q9Y3E1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HDGFL3Q9Y3E1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HDGFL3Q9Y3E1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDGFL3Q9Y3E1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HDGFL3Q9Y3E1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDGFL3Q9Y3E1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HDGFL3Q9Y3E1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDGFL3Q9Y3E1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDGFL3Q9Y3E1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDGFL3Q9Y3E1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDGFL3Q9Y3E1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDGFL3Q9Y3E1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDGFL3Q9Y3E1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDGFL3Q9Y3E1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDGFL3Q9Y3E1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDGFL3Q9Y3E1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDGFL3Q9Y3E1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDGFL3Q9Y3E1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDGFL3Q9Y3E1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDGFL3Q9Y3E1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDGFL3Q9Y3E1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDGFL3Q9Y3E1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HDGFL3Q9Y3E1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDGFL3Q9Y3E1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms