Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B4

SF3B6, Splicing factor 3B subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B6Q9Y3B4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SF3B6Q9Y3B4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SF3B6Q9Y3B4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SF3B6Q9Y3B4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SF3B6Q9Y3B4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SF3B6Q9Y3B4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SF3B6Q9Y3B4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SF3B6Q9Y3B4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SF3B6Q9Y3B4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SF3B6Q9Y3B4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SF3B6Q9Y3B4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SF3B6Q9Y3B4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SF3B6Q9Y3B4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms