Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRG3Q9Y2Y8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRG3Q9Y2Y8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRG3Q9Y2Y8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRG3Q9Y2Y8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRG3Q9Y2Y8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRG3Q9Y2Y8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRG3Q9Y2Y8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRG3Q9Y2Y8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRG3Q9Y2Y8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PRG3Q9Y2Y8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRG3Q9Y2Y8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRG3Q9Y2Y8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRG3Q9Y2Y8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRG3Q9Y2Y8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRG3Q9Y2Y8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRG3Q9Y2Y8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PRG3Q9Y2Y8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRG3Q9Y2Y8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRG3Q9Y2Y8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRG3Q9Y2Y8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRG3Q9Y2Y8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRG3Q9Y2Y8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRG3Q9Y2Y8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRG3Q9Y2Y8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRG3Q9Y2Y8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRG3Q9Y2Y8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRG3Q9Y2Y8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRG3Q9Y2Y8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRG3Q9Y2Y8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRG3Q9Y2Y8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRG3Q9Y2Y8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PRG3Q9Y2Y8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRG3Q9Y2Y8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRG3Q9Y2Y8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRG3Q9Y2Y8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRG3Q9Y2Y8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRG3Q9Y2Y8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRG3Q9Y2Y8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRG3Q9Y2Y8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRG3Q9Y2Y8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PRG3Q9Y2Y8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRG3Q9Y2Y8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRG3Q9Y2Y8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRG3Q9Y2Y8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRG3Q9Y2Y8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRG3Q9Y2Y8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRG3Q9Y2Y8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PRG3Q9Y2Y8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRG3Q9Y2Y8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRG3Q9Y2Y8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRG3Q9Y2Y8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRG3Q9Y2Y8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG3Q9Y2Y8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG3Q9Y2Y8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG3Q9Y2Y8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG3Q9Y2Y8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG3Q9Y2Y8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG3Q9Y2Y8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG3Q9Y2Y8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG3Q9Y2Y8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRG3Q9Y2Y8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PRG3Q9Y2Y8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRG3Q9Y2Y8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRG3Q9Y2Y8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRG3Q9Y2Y8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRG3Q9Y2Y8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRG3Q9Y2Y8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRG3Q9Y2Y8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRG3Q9Y2Y8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRG3Q9Y2Y8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRG3Q9Y2Y8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PRG3Q9Y2Y8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRG3Q9Y2Y8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRG3Q9Y2Y8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRG3Q9Y2Y8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PRG3Q9Y2Y8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRG3Q9Y2Y8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRG3Q9Y2Y8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRG3Q9Y2Y8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRG3Q9Y2Y8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRG3Q9Y2Y8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRG3Q9Y2Y8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRG3Q9Y2Y8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PRG3Q9Y2Y8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRG3Q9Y2Y8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRG3Q9Y2Y8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRG3Q9Y2Y8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRG3Q9Y2Y8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRG3Q9Y2Y8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRG3Q9Y2Y8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRG3Q9Y2Y8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRG3Q9Y2Y8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRG3Q9Y2Y8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRG3Q9Y2Y8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PRG3Q9Y2Y8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRG3Q9Y2Y8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRG3Q9Y2Y8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRG3Q9Y2Y8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRG3Q9Y2Y8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms