Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP3M1Q9Y2T2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
AP3M1Q9Y2T2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AP3M1Q9Y2T2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP3M1Q9Y2T2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP3M1Q9Y2T2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP3M1Q9Y2T2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
AP3M1Q9Y2T2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP3M1Q9Y2T2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP3M1Q9Y2T2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3M1Q9Y2T2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3M1Q9Y2T2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3M1Q9Y2T2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP3M1Q9Y2T2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3M1Q9Y2T2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3M1Q9Y2T2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3M1Q9Y2T2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3M1Q9Y2T2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3M1Q9Y2T2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3M1Q9Y2T2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3M1Q9Y2T2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3M1Q9Y2T2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3M1Q9Y2T2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3M1Q9Y2T2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3M1Q9Y2T2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3M1Q9Y2T2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3M1Q9Y2T2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3M1Q9Y2T2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3M1Q9Y2T2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3M1Q9Y2T2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3M1Q9Y2T2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3M1Q9Y2T2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3M1Q9Y2T2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3M1Q9Y2T2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3M1Q9Y2T2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3M1Q9Y2T2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3M1Q9Y2T2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP3M1Q9Y2T2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP3M1Q9Y2T2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3M1Q9Y2T2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3M1Q9Y2T2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3M1Q9Y2T2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3M1Q9Y2T2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3M1Q9Y2T2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3M1Q9Y2T2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3M1Q9Y2T2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3M1Q9Y2T2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3M1Q9Y2T2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3M1Q9Y2T2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3M1Q9Y2T2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3M1Q9Y2T2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3M1Q9Y2T2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3M1Q9Y2T2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3M1Q9Y2T2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3M1Q9Y2T2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3M1Q9Y2T2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3M1Q9Y2T2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3M1Q9Y2T2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3M1Q9Y2T2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3M1Q9Y2T2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3M1Q9Y2T2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3M1Q9Y2T2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3M1Q9Y2T2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3M1Q9Y2T2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3M1Q9Y2T2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3M1Q9Y2T2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3M1Q9Y2T2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3M1Q9Y2T2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3M1Q9Y2T2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3M1Q9Y2T2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3M1Q9Y2T2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3M1Q9Y2T2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3M1Q9Y2T2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3M1Q9Y2T2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3M1Q9Y2T2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms