Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2P5

SLC27A5, Bile acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A5Q9Y2P5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC27A5Q9Y2P5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC27A5Q9Y2P5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC27A5Q9Y2P5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC27A5Q9Y2P5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC27A5Q9Y2P5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC27A5Q9Y2P5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC27A5Q9Y2P5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC27A5Q9Y2P5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC27A5Q9Y2P5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC27A5Q9Y2P5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC27A5Q9Y2P5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC27A5Q9Y2P5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC27A5Q9Y2P5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A5Q9Y2P5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A5Q9Y2P5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A5Q9Y2P5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A5Q9Y2P5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A5Q9Y2P5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC27A5Q9Y2P5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC27A5Q9Y2P5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC27A5Q9Y2P5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC27A5Q9Y2P5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC27A5Q9Y2P5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC27A5Q9Y2P5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC27A5Q9Y2P5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A5Q9Y2P5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A5Q9Y2P5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A5Q9Y2P5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A5Q9Y2P5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A5Q9Y2P5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A5Q9Y2P5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A5Q9Y2P5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC27A5Q9Y2P5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC27A5Q9Y2P5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC27A5Q9Y2P5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC27A5Q9Y2P5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC27A5Q9Y2P5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC27A5Q9Y2P5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC27A5Q9Y2P5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC27A5Q9Y2P5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC27A5Q9Y2P5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC27A5Q9Y2P5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC27A5Q9Y2P5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC27A5Q9Y2P5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC27A5Q9Y2P5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC27A5Q9Y2P5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC27A5Q9Y2P5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC27A5Q9Y2P5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC27A5Q9Y2P5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC27A5Q9Y2P5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms