Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
KDM2AQ9Y2K7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
KDM2AQ9Y2K7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
KDM2AQ9Y2K7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
KDM2AQ9Y2K7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
KDM2AQ9Y2K7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
KDM2AQ9Y2K7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
KDM2AQ9Y2K7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
KDM2AQ9Y2K7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
KDM2AQ9Y2K7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
KDM2AQ9Y2K7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
KDM2AQ9Y2K7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
KDM2AQ9Y2K7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
KDM2AQ9Y2K7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
KDM2AQ9Y2K7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
KDM2AQ9Y2K7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
KDM2AQ9Y2K7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
KDM2AQ9Y2K7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
KDM2AQ9Y2K7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
KDM2AQ9Y2K7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
KDM2AQ9Y2K7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
KDM2AQ9Y2K7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
KDM2AQ9Y2K7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
KDM2AQ9Y2K7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
KDM2AQ9Y2K7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
KDM2AQ9Y2K7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
KDM2AQ9Y2K7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
KDM2AQ9Y2K7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
KDM2AQ9Y2K7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
KDM2AQ9Y2K7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
KDM2AQ9Y2K7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
KDM2AQ9Y2K7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
KDM2AQ9Y2K7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
KDM2AQ9Y2K7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
KDM2AQ9Y2K7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
KDM2AQ9Y2K7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
KDM2AQ9Y2K7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
KDM2AQ9Y2K7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
KDM2AQ9Y2K7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
KDM2AQ9Y2K7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
KDM2AQ9Y2K7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
KDM2AQ9Y2K7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
KDM2AQ9Y2K7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
KDM2AQ9Y2K7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
KDM2AQ9Y2K7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
KDM2AQ9Y2K7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
KDM2AQ9Y2K7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
KDM2AQ9Y2K7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
KDM2AQ9Y2K7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
KDM2AQ9Y2K7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
KDM2AQ9Y2K7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
KDM2AQ9Y2K7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
KDM2AQ9Y2K7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
KDM2AQ9Y2K7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
KDM2AQ9Y2K7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
KDM2AQ9Y2K7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
KDM2AQ9Y2K7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
KDM2AQ9Y2K7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
KDM2AQ9Y2K7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
KDM2AQ9Y2K7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
KDM2AQ9Y2K7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
KDM2AQ9Y2K7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
KDM2AQ9Y2K7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
KDM2AQ9Y2K7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
KDM2AQ9Y2K7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
KDM2AQ9Y2K7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
KDM2AQ9Y2K7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
KDM2AQ9Y2K7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
KDM2AQ9Y2K7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
KDM2AQ9Y2K7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
KDM2AQ9Y2K7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
KDM2AQ9Y2K7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
KDM2AQ9Y2K7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
KDM2AQ9Y2K7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
KDM2AQ9Y2K7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
KDM2AQ9Y2K7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
KDM2AQ9Y2K7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
KDM2AQ9Y2K7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
KDM2AQ9Y2K7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
KDM2AQ9Y2K7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
KDM2AQ9Y2K7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
KDM2AQ9Y2K7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
KDM2AQ9Y2K7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
KDM2AQ9Y2K7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
KDM2AQ9Y2K7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
KDM2AQ9Y2K7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
KDM2AQ9Y2K7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
KDM2AQ9Y2K7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
KDM2AQ9Y2K7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
KDM2AQ9Y2K7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
KDM2AQ9Y2K7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
KDM2AQ9Y2K7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
KDM2AQ9Y2K7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
KDM2AQ9Y2K7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
KDM2AQ9Y2K7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
KDM2AQ9Y2K7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
KDM2AQ9Y2K7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
KDM2AQ9Y2K7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
KDM2AQ9Y2K7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
KDM2AQ9Y2K7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms