Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y279

VSIG4, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG4Q9Y279 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSIG4Q9Y279 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSIG4Q9Y279 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSIG4Q9Y279 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSIG4Q9Y279 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VSIG4Q9Y279 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VSIG4Q9Y279 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VSIG4Q9Y279 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VSIG4Q9Y279 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VSIG4Q9Y279 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VSIG4Q9Y279 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VSIG4Q9Y279 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
VSIG4Q9Y279 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VSIG4Q9Y279 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VSIG4Q9Y279 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VSIG4Q9Y279 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VSIG4Q9Y279 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VSIG4Q9Y279 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
VSIG4Q9Y279 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSIG4Q9Y279 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSIG4Q9Y279 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSIG4Q9Y279 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSIG4Q9Y279 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSIG4Q9Y279 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSIG4Q9Y279 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSIG4Q9Y279 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSIG4Q9Y279 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSIG4Q9Y279 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSIG4Q9Y279 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSIG4Q9Y279 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSIG4Q9Y279 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSIG4Q9Y279 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSIG4Q9Y279 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSIG4Q9Y279 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSIG4Q9Y279 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSIG4Q9Y279 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSIG4Q9Y279 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSIG4Q9Y279 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSIG4Q9Y279 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
VSIG4Q9Y279 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSIG4Q9Y279 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSIG4Q9Y279 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSIG4Q9Y279 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSIG4Q9Y279 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSIG4Q9Y279 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSIG4Q9Y279 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSIG4Q9Y279 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSIG4Q9Y279 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSIG4Q9Y279 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSIG4Q9Y279 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSIG4Q9Y279 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
VSIG4Q9Y279 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSIG4Q9Y279 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSIG4Q9Y279 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSIG4Q9Y279 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSIG4Q9Y279 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSIG4Q9Y279 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSIG4Q9Y279 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSIG4Q9Y279 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSIG4Q9Y279 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VSIG4Q9Y279 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSIG4Q9Y279 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSIG4Q9Y279 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSIG4Q9Y279 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSIG4Q9Y279 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSIG4Q9Y279 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSIG4Q9Y279 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSIG4Q9Y279 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSIG4Q9Y279 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSIG4Q9Y279 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSIG4Q9Y279 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSIG4Q9Y279 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSIG4Q9Y279 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSIG4Q9Y279 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSIG4Q9Y279 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSIG4Q9Y279 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSIG4Q9Y279 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSIG4Q9Y279 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSIG4Q9Y279 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSIG4Q9Y279 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSIG4Q9Y279 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSIG4Q9Y279 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSIG4Q9Y279 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSIG4Q9Y279 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSIG4Q9Y279 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSIG4Q9Y279 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSIG4Q9Y279 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSIG4Q9Y279 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSIG4Q9Y279 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSIG4Q9Y279 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSIG4Q9Y279 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSIG4Q9Y279 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSIG4Q9Y279 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSIG4Q9Y279 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
VSIG4Q9Y279 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSIG4Q9Y279 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSIG4Q9Y279 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSIG4Q9Y279 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSIG4Q9Y279 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSIG4Q9Y279 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.2 ms