Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN8AQ9UQD0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN8AQ9UQD0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN8AQ9UQD0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN8AQ9UQD0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN8AQ9UQD0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN8AQ9UQD0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN8AQ9UQD0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN8AQ9UQD0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN8AQ9UQD0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN8AQ9UQD0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN8AQ9UQD0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN8AQ9UQD0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN8AQ9UQD0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN8AQ9UQD0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN8AQ9UQD0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN8AQ9UQD0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN8AQ9UQD0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN8AQ9UQD0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.43
SCN8AQ9UQD0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SCN8AQ9UQD0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
SCN8AQ9UQD0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
SCN8AQ9UQD0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN8AQ9UQD0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN8AQ9UQD0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN8AQ9UQD0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN8AQ9UQD0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN8AQ9UQD0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN8AQ9UQD0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCN8AQ9UQD0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCN8AQ9UQD0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCN8AQ9UQD0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCN8AQ9UQD0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SCN8AQ9UQD0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCN8AQ9UQD0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SCN8AQ9UQD0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN8AQ9UQD0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN8AQ9UQD0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN8AQ9UQD0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN8AQ9UQD0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN8AQ9UQD0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN8AQ9UQD0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN8AQ9UQD0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN8AQ9UQD0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN8AQ9UQD0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN8AQ9UQD0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN8AQ9UQD0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN8AQ9UQD0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN8AQ9UQD0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN8AQ9UQD0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN8AQ9UQD0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN8AQ9UQD0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN8AQ9UQD0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN8AQ9UQD0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCN8AQ9UQD0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN8AQ9UQD0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN8AQ9UQD0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN8AQ9UQD0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN8AQ9UQD0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN8AQ9UQD0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN8AQ9UQD0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN8AQ9UQD0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCN8AQ9UQD0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN8AQ9UQD0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN8AQ9UQD0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN8AQ9UQD0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN8AQ9UQD0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN8AQ9UQD0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN8AQ9UQD0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN8AQ9UQD0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN8AQ9UQD0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCN8AQ9UQD0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN8AQ9UQD0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN8AQ9UQD0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN8AQ9UQD0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN8AQ9UQD0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN8AQ9UQD0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN8AQ9UQD0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN8AQ9UQD0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCN8AQ9UQD0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN8AQ9UQD0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN8AQ9UQD0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN8AQ9UQD0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN8AQ9UQD0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN8AQ9UQD0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCN8AQ9UQD0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN8AQ9UQD0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN8AQ9UQD0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN8AQ9UQD0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN8AQ9UQD0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN8AQ9UQD0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCN8AQ9UQD0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN8AQ9UQD0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCN8AQ9UQD0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN8AQ9UQD0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN8AQ9UQD0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCN8AQ9UQD0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN8AQ9UQD0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN8AQ9UQD0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SCN8AQ9UQD0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms