Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ88

CDK11A, Cyclin-dependent kinase 11A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11AQ9UQ88 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
CDK11AQ9UQ88 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CDK11AQ9UQ88 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CDK11AQ9UQ88 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CDK11AQ9UQ88 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CDK11AQ9UQ88 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
CDK11AQ9UQ88 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CDK11AQ9UQ88 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CDK11AQ9UQ88 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CDK11AQ9UQ88 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CDK11AQ9UQ88 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CDK11AQ9UQ88 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CDK11AQ9UQ88 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CDK11AQ9UQ88 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CDK11AQ9UQ88 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CDK11AQ9UQ88 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
CDK11AQ9UQ88 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CDK11AQ9UQ88 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CDK11AQ9UQ88 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
CDK11AQ9UQ88 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
CDK11AQ9UQ88 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
CDK11AQ9UQ88 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
CDK11AQ9UQ88 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CDK11AQ9UQ88 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
CDK11AQ9UQ88 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
CDK11AQ9UQ88 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
CDK11AQ9UQ88 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
CDK11AQ9UQ88 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC37.62■■■■□ 3.61
CDK11AQ9UQ88 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
CDK11AQ9UQ88 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
CDK11AQ9UQ88 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CDK11AQ9UQ88 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CDK11AQ9UQ88 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CDK11AQ9UQ88 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CDK11AQ9UQ88 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CDK11AQ9UQ88 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CDK11AQ9UQ88 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CDK11AQ9UQ88 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CDK11AQ9UQ88 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CDK11AQ9UQ88 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CDK11AQ9UQ88 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
CDK11AQ9UQ88 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CDK11AQ9UQ88 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CDK11AQ9UQ88 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CDK11AQ9UQ88 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CDK11AQ9UQ88 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
CDK11AQ9UQ88 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
CDK11AQ9UQ88 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.6
CDK11AQ9UQ88 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
CDK11AQ9UQ88 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
CDK11AQ9UQ88 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
CDK11AQ9UQ88 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
CDK11AQ9UQ88 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
CDK11AQ9UQ88 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
CDK11AQ9UQ88 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
CDK11AQ9UQ88 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
CDK11AQ9UQ88 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CDK11AQ9UQ88 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CDK11AQ9UQ88 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CDK11AQ9UQ88 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CDK11AQ9UQ88 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CDK11AQ9UQ88 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CDK11AQ9UQ88 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CDK11AQ9UQ88 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CDK11AQ9UQ88 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CDK11AQ9UQ88 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CDK11AQ9UQ88 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CDK11AQ9UQ88 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CDK11AQ9UQ88 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CDK11AQ9UQ88 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CDK11AQ9UQ88 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
CDK11AQ9UQ88 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
CDK11AQ9UQ88 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
CDK11AQ9UQ88 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
CDK11AQ9UQ88 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
CDK11AQ9UQ88 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC37.51■■■■□ 3.6
CDK11AQ9UQ88 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
CDK11AQ9UQ88 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
CDK11AQ9UQ88 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CDK11AQ9UQ88 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CDK11AQ9UQ88 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CDK11AQ9UQ88 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CDK11AQ9UQ88 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
CDK11AQ9UQ88 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
CDK11AQ9UQ88 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CDK11AQ9UQ88 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CDK11AQ9UQ88 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CDK11AQ9UQ88 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CDK11AQ9UQ88 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CDK11AQ9UQ88 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CDK11AQ9UQ88 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CDK11AQ9UQ88 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CDK11AQ9UQ88 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CDK11AQ9UQ88 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CDK11AQ9UQ88 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CDK11AQ9UQ88 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CDK11AQ9UQ88 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CDK11AQ9UQ88 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CDK11AQ9UQ88 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CDK11AQ9UQ88 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms