Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEU3Q9UQ49 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEU3Q9UQ49 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEU3Q9UQ49 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEU3Q9UQ49 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEU3Q9UQ49 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEU3Q9UQ49 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEU3Q9UQ49 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEU3Q9UQ49 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEU3Q9UQ49 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEU3Q9UQ49 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEU3Q9UQ49 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NEU3Q9UQ49 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEU3Q9UQ49 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEU3Q9UQ49 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEU3Q9UQ49 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEU3Q9UQ49 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEU3Q9UQ49 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEU3Q9UQ49 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEU3Q9UQ49 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEU3Q9UQ49 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEU3Q9UQ49 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEU3Q9UQ49 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEU3Q9UQ49 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEU3Q9UQ49 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEU3Q9UQ49 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEU3Q9UQ49 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEU3Q9UQ49 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEU3Q9UQ49 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEU3Q9UQ49 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEU3Q9UQ49 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEU3Q9UQ49 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEU3Q9UQ49 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEU3Q9UQ49 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEU3Q9UQ49 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEU3Q9UQ49 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEU3Q9UQ49 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEU3Q9UQ49 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEU3Q9UQ49 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEU3Q9UQ49 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEU3Q9UQ49 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEU3Q9UQ49 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEU3Q9UQ49 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEU3Q9UQ49 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEU3Q9UQ49 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEU3Q9UQ49 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEU3Q9UQ49 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEU3Q9UQ49 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEU3Q9UQ49 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEU3Q9UQ49 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEU3Q9UQ49 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEU3Q9UQ49 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEU3Q9UQ49 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEU3Q9UQ49 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NEU3Q9UQ49 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEU3Q9UQ49 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEU3Q9UQ49 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEU3Q9UQ49 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEU3Q9UQ49 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NEU3Q9UQ49 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEU3Q9UQ49 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEU3Q9UQ49 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEU3Q9UQ49 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEU3Q9UQ49 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEU3Q9UQ49 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEU3Q9UQ49 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEU3Q9UQ49 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEU3Q9UQ49 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEU3Q9UQ49 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEU3Q9UQ49 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEU3Q9UQ49 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEU3Q9UQ49 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEU3Q9UQ49 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEU3Q9UQ49 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEU3Q9UQ49 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEU3Q9UQ49 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEU3Q9UQ49 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEU3Q9UQ49 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEU3Q9UQ49 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEU3Q9UQ49 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NEU3Q9UQ49 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEU3Q9UQ49 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NEU3Q9UQ49 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NEU3Q9UQ49 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEU3Q9UQ49 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEU3Q9UQ49 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEU3Q9UQ49 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEU3Q9UQ49 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NEU3Q9UQ49 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEU3Q9UQ49 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEU3Q9UQ49 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEU3Q9UQ49 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NEU3Q9UQ49 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEU3Q9UQ49 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEU3Q9UQ49 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEU3Q9UQ49 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEU3Q9UQ49 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEU3Q9UQ49 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEU3Q9UQ49 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEU3Q9UQ49 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms