Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM00

TMCO1, Calcium load-activated calcium channel, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO1Q9UM00 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMCO1Q9UM00 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMCO1Q9UM00 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMCO1Q9UM00 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TMCO1Q9UM00 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMCO1Q9UM00 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMCO1Q9UM00 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMCO1Q9UM00 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMCO1Q9UM00 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMCO1Q9UM00 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMCO1Q9UM00 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMCO1Q9UM00 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMCO1Q9UM00 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMCO1Q9UM00 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMCO1Q9UM00 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMCO1Q9UM00 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMCO1Q9UM00 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMCO1Q9UM00 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMCO1Q9UM00 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMCO1Q9UM00 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMCO1Q9UM00 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMCO1Q9UM00 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMCO1Q9UM00 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMCO1Q9UM00 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMCO1Q9UM00 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMCO1Q9UM00 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMCO1Q9UM00 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMCO1Q9UM00 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMCO1Q9UM00 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TMCO1Q9UM00 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TMCO1Q9UM00 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMCO1Q9UM00 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMCO1Q9UM00 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMCO1Q9UM00 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMCO1Q9UM00 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMCO1Q9UM00 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMCO1Q9UM00 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMCO1Q9UM00 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMCO1Q9UM00 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMCO1Q9UM00 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMCO1Q9UM00 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMCO1Q9UM00 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMCO1Q9UM00 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMCO1Q9UM00 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMCO1Q9UM00 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMCO1Q9UM00 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMCO1Q9UM00 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMCO1Q9UM00 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMCO1Q9UM00 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMCO1Q9UM00 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMCO1Q9UM00 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMCO1Q9UM00 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMCO1Q9UM00 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMCO1Q9UM00 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMCO1Q9UM00 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMCO1Q9UM00 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMCO1Q9UM00 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMCO1Q9UM00 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMCO1Q9UM00 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMCO1Q9UM00 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMCO1Q9UM00 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMCO1Q9UM00 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO1Q9UM00 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO1Q9UM00 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO1Q9UM00 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO1Q9UM00 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO1Q9UM00 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO1Q9UM00 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO1Q9UM00 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO1Q9UM00 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO1Q9UM00 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO1Q9UM00 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO1Q9UM00 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO1Q9UM00 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO1Q9UM00 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO1Q9UM00 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO1Q9UM00 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMCO1Q9UM00 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO1Q9UM00 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO1Q9UM00 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO1Q9UM00 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO1Q9UM00 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO1Q9UM00 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMCO1Q9UM00 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCO1Q9UM00 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCO1Q9UM00 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCO1Q9UM00 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCO1Q9UM00 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCO1Q9UM00 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCO1Q9UM00 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCO1Q9UM00 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMCO1Q9UM00 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO1Q9UM00 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO1Q9UM00 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO1Q9UM00 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO1Q9UM00 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO1Q9UM00 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMCO1Q9UM00 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO1Q9UM00 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMCO1Q9UM00 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms