Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TSKSQ9UJT2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TSKSQ9UJT2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TSKSQ9UJT2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TSKSQ9UJT2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TSKSQ9UJT2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TSKSQ9UJT2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TSKSQ9UJT2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TSKSQ9UJT2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TSKSQ9UJT2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TSKSQ9UJT2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TSKSQ9UJT2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TSKSQ9UJT2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TSKSQ9UJT2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TSKSQ9UJT2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TSKSQ9UJT2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TSKSQ9UJT2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TSKSQ9UJT2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TSKSQ9UJT2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TSKSQ9UJT2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TSKSQ9UJT2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TSKSQ9UJT2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TSKSQ9UJT2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TSKSQ9UJT2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TSKSQ9UJT2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TSKSQ9UJT2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TSKSQ9UJT2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TSKSQ9UJT2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TSKSQ9UJT2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TSKSQ9UJT2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TSKSQ9UJT2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TSKSQ9UJT2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TSKSQ9UJT2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TSKSQ9UJT2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TSKSQ9UJT2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TSKSQ9UJT2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TSKSQ9UJT2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TSKSQ9UJT2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TSKSQ9UJT2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TSKSQ9UJT2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TSKSQ9UJT2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TSKSQ9UJT2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TSKSQ9UJT2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TSKSQ9UJT2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TSKSQ9UJT2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TSKSQ9UJT2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TSKSQ9UJT2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TSKSQ9UJT2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TSKSQ9UJT2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TSKSQ9UJT2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TSKSQ9UJT2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TSKSQ9UJT2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TSKSQ9UJT2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TSKSQ9UJT2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TSKSQ9UJT2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TSKSQ9UJT2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TSKSQ9UJT2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TSKSQ9UJT2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TSKSQ9UJT2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TSKSQ9UJT2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TSKSQ9UJT2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TSKSQ9UJT2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TSKSQ9UJT2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TSKSQ9UJT2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TSKSQ9UJT2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TSKSQ9UJT2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TSKSQ9UJT2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TSKSQ9UJT2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TSKSQ9UJT2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TSKSQ9UJT2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TSKSQ9UJT2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TSKSQ9UJT2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TSKSQ9UJT2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TSKSQ9UJT2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TSKSQ9UJT2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TSKSQ9UJT2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TSKSQ9UJT2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TSKSQ9UJT2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TSKSQ9UJT2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TSKSQ9UJT2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TSKSQ9UJT2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TSKSQ9UJT2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TSKSQ9UJT2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TSKSQ9UJT2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TSKSQ9UJT2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TSKSQ9UJT2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TSKSQ9UJT2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TSKSQ9UJT2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TSKSQ9UJT2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TSKSQ9UJT2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TSKSQ9UJT2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TSKSQ9UJT2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TSKSQ9UJT2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TSKSQ9UJT2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TSKSQ9UJT2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TSKSQ9UJT2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TSKSQ9UJT2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TSKSQ9UJT2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TSKSQ9UJT2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TSKSQ9UJT2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms