Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIU6

SIX4, Homeobox protein SIX4, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX4Q9UIU6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIX4Q9UIU6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIX4Q9UIU6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIX4Q9UIU6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SIX4Q9UIU6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIX4Q9UIU6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIX4Q9UIU6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIX4Q9UIU6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIX4Q9UIU6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIX4Q9UIU6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIX4Q9UIU6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIX4Q9UIU6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIX4Q9UIU6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIX4Q9UIU6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIX4Q9UIU6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIX4Q9UIU6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIX4Q9UIU6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIX4Q9UIU6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIX4Q9UIU6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIX4Q9UIU6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIX4Q9UIU6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIX4Q9UIU6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIX4Q9UIU6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIX4Q9UIU6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIX4Q9UIU6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIX4Q9UIU6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIX4Q9UIU6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIX4Q9UIU6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIX4Q9UIU6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIX4Q9UIU6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIX4Q9UIU6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIX4Q9UIU6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SIX4Q9UIU6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
SIX4Q9UIU6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SIX4Q9UIU6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIX4Q9UIU6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIX4Q9UIU6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIX4Q9UIU6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIX4Q9UIU6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIX4Q9UIU6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIX4Q9UIU6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIX4Q9UIU6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIX4Q9UIU6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIX4Q9UIU6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIX4Q9UIU6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SIX4Q9UIU6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIX4Q9UIU6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIX4Q9UIU6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIX4Q9UIU6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIX4Q9UIU6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SIX4Q9UIU6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIX4Q9UIU6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIX4Q9UIU6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIX4Q9UIU6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIX4Q9UIU6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIX4Q9UIU6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIX4Q9UIU6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIX4Q9UIU6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIX4Q9UIU6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIX4Q9UIU6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIX4Q9UIU6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIX4Q9UIU6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIX4Q9UIU6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIX4Q9UIU6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIX4Q9UIU6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIX4Q9UIU6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIX4Q9UIU6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIX4Q9UIU6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIX4Q9UIU6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIX4Q9UIU6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SIX4Q9UIU6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIX4Q9UIU6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SIX4Q9UIU6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIX4Q9UIU6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIX4Q9UIU6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIX4Q9UIU6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIX4Q9UIU6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIX4Q9UIU6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIX4Q9UIU6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIX4Q9UIU6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SIX4Q9UIU6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIX4Q9UIU6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIX4Q9UIU6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIX4Q9UIU6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIX4Q9UIU6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIX4Q9UIU6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIX4Q9UIU6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIX4Q9UIU6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIX4Q9UIU6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIX4Q9UIU6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIX4Q9UIU6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIX4Q9UIU6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIX4Q9UIU6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SIX4Q9UIU6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIX4Q9UIU6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIX4Q9UIU6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIX4Q9UIU6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIX4Q9UIU6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIX4Q9UIU6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SIX4Q9UIU6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms