Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL1

SCOC, Short coiled-coil protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCOCQ9UIL1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCOCQ9UIL1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCOCQ9UIL1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCOCQ9UIL1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCOCQ9UIL1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCOCQ9UIL1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCOCQ9UIL1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCOCQ9UIL1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCOCQ9UIL1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCOCQ9UIL1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCOCQ9UIL1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCOCQ9UIL1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCOCQ9UIL1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCOCQ9UIL1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCOCQ9UIL1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCOCQ9UIL1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SCOCQ9UIL1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCOCQ9UIL1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCOCQ9UIL1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCOCQ9UIL1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCOCQ9UIL1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCOCQ9UIL1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCOCQ9UIL1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCOCQ9UIL1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCOCQ9UIL1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCOCQ9UIL1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SCOCQ9UIL1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCOCQ9UIL1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCOCQ9UIL1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCOCQ9UIL1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCOCQ9UIL1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCOCQ9UIL1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCOCQ9UIL1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCOCQ9UIL1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCOCQ9UIL1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCOCQ9UIL1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCOCQ9UIL1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCOCQ9UIL1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCOCQ9UIL1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCOCQ9UIL1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCOCQ9UIL1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCOCQ9UIL1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCOCQ9UIL1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCOCQ9UIL1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCOCQ9UIL1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCOCQ9UIL1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCOCQ9UIL1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCOCQ9UIL1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCOCQ9UIL1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCOCQ9UIL1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCOCQ9UIL1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCOCQ9UIL1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCOCQ9UIL1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCOCQ9UIL1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCOCQ9UIL1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCOCQ9UIL1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCOCQ9UIL1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCOCQ9UIL1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCOCQ9UIL1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCOCQ9UIL1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCOCQ9UIL1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SCOCQ9UIL1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCOCQ9UIL1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCOCQ9UIL1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCOCQ9UIL1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SCOCQ9UIL1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCOCQ9UIL1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCOCQ9UIL1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCOCQ9UIL1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCOCQ9UIL1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCOCQ9UIL1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCOCQ9UIL1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SCOCQ9UIL1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms