Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH03

SEPT3, Neuronal-specific septin-3, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT3Q9UH03 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEPT3Q9UH03 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEPT3Q9UH03 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SEPT3Q9UH03 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEPT3Q9UH03 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEPT3Q9UH03 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEPT3Q9UH03 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SEPT3Q9UH03 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SEPT3Q9UH03 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEPT3Q9UH03 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEPT3Q9UH03 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEPT3Q9UH03 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEPT3Q9UH03 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEPT3Q9UH03 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SEPT3Q9UH03 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEPT3Q9UH03 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SEPT3Q9UH03 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEPT3Q9UH03 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEPT3Q9UH03 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEPT3Q9UH03 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEPT3Q9UH03 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEPT3Q9UH03 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEPT3Q9UH03 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEPT3Q9UH03 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEPT3Q9UH03 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEPT3Q9UH03 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEPT3Q9UH03 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEPT3Q9UH03 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SEPT3Q9UH03 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEPT3Q9UH03 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEPT3Q9UH03 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEPT3Q9UH03 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEPT3Q9UH03 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEPT3Q9UH03 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEPT3Q9UH03 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEPT3Q9UH03 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SEPT3Q9UH03 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEPT3Q9UH03 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEPT3Q9UH03 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEPT3Q9UH03 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEPT3Q9UH03 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEPT3Q9UH03 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEPT3Q9UH03 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SEPT3Q9UH03 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEPT3Q9UH03 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEPT3Q9UH03 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEPT3Q9UH03 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEPT3Q9UH03 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEPT3Q9UH03 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEPT3Q9UH03 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEPT3Q9UH03 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEPT3Q9UH03 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEPT3Q9UH03 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEPT3Q9UH03 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEPT3Q9UH03 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEPT3Q9UH03 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEPT3Q9UH03 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEPT3Q9UH03 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEPT3Q9UH03 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEPT3Q9UH03 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SEPT3Q9UH03 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEPT3Q9UH03 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEPT3Q9UH03 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SEPT3Q9UH03 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEPT3Q9UH03 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEPT3Q9UH03 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEPT3Q9UH03 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEPT3Q9UH03 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEPT3Q9UH03 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SEPT3Q9UH03 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEPT3Q9UH03 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEPT3Q9UH03 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SEPT3Q9UH03 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEPT3Q9UH03 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEPT3Q9UH03 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEPT3Q9UH03 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEPT3Q9UH03 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEPT3Q9UH03 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEPT3Q9UH03 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEPT3Q9UH03 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEPT3Q9UH03 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEPT3Q9UH03 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEPT3Q9UH03 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEPT3Q9UH03 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEPT3Q9UH03 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEPT3Q9UH03 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SEPT3Q9UH03 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEPT3Q9UH03 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SEPT3Q9UH03 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SEPT3Q9UH03 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEPT3Q9UH03 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEPT3Q9UH03 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEPT3Q9UH03 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEPT3Q9UH03 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEPT3Q9UH03 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEPT3Q9UH03 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEPT3Q9UH03 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEPT3Q9UH03 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEPT3Q9UH03 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEPT3Q9UH03 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms