Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL42Q9P2K6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL42Q9P2K6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL42Q9P2K6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL42Q9P2K6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL42Q9P2K6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL42Q9P2K6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL42Q9P2K6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL42Q9P2K6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL42Q9P2K6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL42Q9P2K6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL42Q9P2K6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL42Q9P2K6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL42Q9P2K6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL42Q9P2K6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL42Q9P2K6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL42Q9P2K6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL42Q9P2K6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL42Q9P2K6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL42Q9P2K6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL42Q9P2K6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL42Q9P2K6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL42Q9P2K6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL42Q9P2K6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL42Q9P2K6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL42Q9P2K6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL42Q9P2K6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL42Q9P2K6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL42Q9P2K6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL42Q9P2K6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL42Q9P2K6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL42Q9P2K6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL42Q9P2K6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL42Q9P2K6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL42Q9P2K6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL42Q9P2K6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL42Q9P2K6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL42Q9P2K6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL42Q9P2K6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL42Q9P2K6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL42Q9P2K6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL42Q9P2K6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL42Q9P2K6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL42Q9P2K6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL42Q9P2K6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL42Q9P2K6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL42Q9P2K6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL42Q9P2K6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL42Q9P2K6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL42Q9P2K6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL42Q9P2K6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL42Q9P2K6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL42Q9P2K6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL42Q9P2K6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL42Q9P2K6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL42Q9P2K6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL42Q9P2K6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL42Q9P2K6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL42Q9P2K6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL42Q9P2K6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL42Q9P2K6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL42Q9P2K6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL42Q9P2K6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL42Q9P2K6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL42Q9P2K6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL42Q9P2K6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL42Q9P2K6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL42Q9P2K6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL42Q9P2K6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL42Q9P2K6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL42Q9P2K6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL42Q9P2K6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL42Q9P2K6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL42Q9P2K6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL42Q9P2K6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL42Q9P2K6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL42Q9P2K6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL42Q9P2K6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL42Q9P2K6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL42Q9P2K6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL42Q9P2K6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL42Q9P2K6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL42Q9P2K6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL42Q9P2K6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL42Q9P2K6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL42Q9P2K6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL42Q9P2K6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL42Q9P2K6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL42Q9P2K6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KLHL42Q9P2K6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KLHL42Q9P2K6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL42Q9P2K6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL42Q9P2K6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL42Q9P2K6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL42Q9P2K6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL42Q9P2K6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL42Q9P2K6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL42Q9P2K6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL42Q9P2K6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL42Q9P2K6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms