Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IFNKQ9P0W0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IFNKQ9P0W0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IFNKQ9P0W0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IFNKQ9P0W0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IFNKQ9P0W0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IFNKQ9P0W0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
IFNKQ9P0W0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFNKQ9P0W0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFNKQ9P0W0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFNKQ9P0W0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFNKQ9P0W0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFNKQ9P0W0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFNKQ9P0W0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFNKQ9P0W0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFNKQ9P0W0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
IFNKQ9P0W0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFNKQ9P0W0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
IFNKQ9P0W0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
IFNKQ9P0W0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
IFNKQ9P0W0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
IFNKQ9P0W0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
IFNKQ9P0W0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
IFNKQ9P0W0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
IFNKQ9P0W0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
IFNKQ9P0W0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
IFNKQ9P0W0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFNKQ9P0W0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFNKQ9P0W0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFNKQ9P0W0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFNKQ9P0W0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFNKQ9P0W0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFNKQ9P0W0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFNKQ9P0W0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFNKQ9P0W0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
IFNKQ9P0W0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFNKQ9P0W0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFNKQ9P0W0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFNKQ9P0W0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFNKQ9P0W0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFNKQ9P0W0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFNKQ9P0W0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFNKQ9P0W0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFNKQ9P0W0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFNKQ9P0W0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFNKQ9P0W0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFNKQ9P0W0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFNKQ9P0W0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFNKQ9P0W0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFNKQ9P0W0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFNKQ9P0W0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms