Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PKD2L1Q9P0L9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PKD2L1Q9P0L9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKD2L1Q9P0L9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKD2L1Q9P0L9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKD2L1Q9P0L9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKD2L1Q9P0L9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PKD2L1Q9P0L9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PKD2L1Q9P0L9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PKD2L1Q9P0L9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PKD2L1Q9P0L9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKD2L1Q9P0L9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKD2L1Q9P0L9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKD2L1Q9P0L9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKD2L1Q9P0L9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PKD2L1Q9P0L9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PKD2L1Q9P0L9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PKD2L1Q9P0L9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PKD2L1Q9P0L9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PKD2L1Q9P0L9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PKD2L1Q9P0L9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PKD2L1Q9P0L9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PKD2L1Q9P0L9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PKD2L1Q9P0L9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PKD2L1Q9P0L9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PKD2L1Q9P0L9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PKD2L1Q9P0L9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PKD2L1Q9P0L9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PKD2L1Q9P0L9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PKD2L1Q9P0L9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKD2L1Q9P0L9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKD2L1Q9P0L9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PKD2L1Q9P0L9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKD2L1Q9P0L9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PKD2L1Q9P0L9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PKD2L1Q9P0L9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PKD2L1Q9P0L9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PKD2L1Q9P0L9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PKD2L1Q9P0L9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PKD2L1Q9P0L9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PKD2L1Q9P0L9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKD2L1Q9P0L9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKD2L1Q9P0L9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKD2L1Q9P0L9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKD2L1Q9P0L9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKD2L1Q9P0L9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKD2L1Q9P0L9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKD2L1Q9P0L9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKD2L1Q9P0L9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKD2L1Q9P0L9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKD2L1Q9P0L9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKD2L1Q9P0L9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PKD2L1Q9P0L9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PKD2L1Q9P0L9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PKD2L1Q9P0L9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PKD2L1Q9P0L9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PKD2L1Q9P0L9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PKD2L1Q9P0L9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PKD2L1Q9P0L9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PKD2L1Q9P0L9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PKD2L1Q9P0L9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PKD2L1Q9P0L9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKD2L1Q9P0L9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKD2L1Q9P0L9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKD2L1Q9P0L9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKD2L1Q9P0L9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PKD2L1Q9P0L9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKD2L1Q9P0L9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKD2L1Q9P0L9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PKD2L1Q9P0L9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PKD2L1Q9P0L9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PKD2L1Q9P0L9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PKD2L1Q9P0L9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PKD2L1Q9P0L9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PKD2L1Q9P0L9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PKD2L1Q9P0L9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PKD2L1Q9P0L9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PKD2L1Q9P0L9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PKD2L1Q9P0L9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PKD2L1Q9P0L9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PKD2L1Q9P0L9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PKD2L1Q9P0L9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PKD2L1Q9P0L9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PKD2L1Q9P0L9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PKD2L1Q9P0L9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PKD2L1Q9P0L9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PKD2L1Q9P0L9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PKD2L1Q9P0L9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PKD2L1Q9P0L9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PKD2L1Q9P0L9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PKD2L1Q9P0L9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PKD2L1Q9P0L9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKD2L1Q9P0L9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKD2L1Q9P0L9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKD2L1Q9P0L9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKD2L1Q9P0L9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKD2L1Q9P0L9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKD2L1Q9P0L9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKD2L1Q9P0L9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKD2L1Q9P0L9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms