Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GDE1Q9NZC3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GDE1Q9NZC3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GDE1Q9NZC3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GDE1Q9NZC3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GDE1Q9NZC3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GDE1Q9NZC3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GDE1Q9NZC3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GDE1Q9NZC3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GDE1Q9NZC3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GDE1Q9NZC3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GDE1Q9NZC3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GDE1Q9NZC3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GDE1Q9NZC3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GDE1Q9NZC3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GDE1Q9NZC3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GDE1Q9NZC3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GDE1Q9NZC3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GDE1Q9NZC3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GDE1Q9NZC3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GDE1Q9NZC3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GDE1Q9NZC3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GDE1Q9NZC3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GDE1Q9NZC3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GDE1Q9NZC3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GDE1Q9NZC3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GDE1Q9NZC3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GDE1Q9NZC3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GDE1Q9NZC3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GDE1Q9NZC3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GDE1Q9NZC3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GDE1Q9NZC3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GDE1Q9NZC3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GDE1Q9NZC3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GDE1Q9NZC3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GDE1Q9NZC3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GDE1Q9NZC3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GDE1Q9NZC3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GDE1Q9NZC3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GDE1Q9NZC3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GDE1Q9NZC3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDE1Q9NZC3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDE1Q9NZC3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GDE1Q9NZC3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDE1Q9NZC3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDE1Q9NZC3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDE1Q9NZC3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDE1Q9NZC3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDE1Q9NZC3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDE1Q9NZC3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GDE1Q9NZC3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GDE1Q9NZC3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDE1Q9NZC3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDE1Q9NZC3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDE1Q9NZC3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDE1Q9NZC3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GDE1Q9NZC3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDE1Q9NZC3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDE1Q9NZC3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDE1Q9NZC3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDE1Q9NZC3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDE1Q9NZC3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GDE1Q9NZC3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDE1Q9NZC3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GDE1Q9NZC3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDE1Q9NZC3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDE1Q9NZC3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDE1Q9NZC3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDE1Q9NZC3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDE1Q9NZC3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDE1Q9NZC3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GDE1Q9NZC3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GDE1Q9NZC3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GDE1Q9NZC3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GDE1Q9NZC3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GDE1Q9NZC3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GDE1Q9NZC3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GDE1Q9NZC3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDE1Q9NZC3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDE1Q9NZC3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDE1Q9NZC3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GDE1Q9NZC3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDE1Q9NZC3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDE1Q9NZC3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDE1Q9NZC3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDE1Q9NZC3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GDE1Q9NZC3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDE1Q9NZC3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDE1Q9NZC3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GDE1Q9NZC3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GDE1Q9NZC3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GDE1Q9NZC3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GDE1Q9NZC3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GDE1Q9NZC3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GDE1Q9NZC3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GDE1Q9NZC3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDE1Q9NZC3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDE1Q9NZC3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDE1Q9NZC3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GDE1Q9NZC3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
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