Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKIRAS1Q9NYS0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKIRAS1Q9NYS0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKIRAS1Q9NYS0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKIRAS1Q9NYS0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKIRAS1Q9NYS0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NKIRAS1Q9NYS0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NKIRAS1Q9NYS0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NKIRAS1Q9NYS0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NKIRAS1Q9NYS0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NKIRAS1Q9NYS0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKIRAS1Q9NYS0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKIRAS1Q9NYS0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKIRAS1Q9NYS0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKIRAS1Q9NYS0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKIRAS1Q9NYS0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKIRAS1Q9NYS0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKIRAS1Q9NYS0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKIRAS1Q9NYS0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKIRAS1Q9NYS0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NKIRAS1Q9NYS0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKIRAS1Q9NYS0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKIRAS1Q9NYS0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKIRAS1Q9NYS0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKIRAS1Q9NYS0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKIRAS1Q9NYS0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKIRAS1Q9NYS0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKIRAS1Q9NYS0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKIRAS1Q9NYS0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKIRAS1Q9NYS0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKIRAS1Q9NYS0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKIRAS1Q9NYS0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKIRAS1Q9NYS0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKIRAS1Q9NYS0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKIRAS1Q9NYS0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKIRAS1Q9NYS0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKIRAS1Q9NYS0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKIRAS1Q9NYS0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKIRAS1Q9NYS0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKIRAS1Q9NYS0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKIRAS1Q9NYS0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKIRAS1Q9NYS0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKIRAS1Q9NYS0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKIRAS1Q9NYS0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKIRAS1Q9NYS0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKIRAS1Q9NYS0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NKIRAS1Q9NYS0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NKIRAS1Q9NYS0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NKIRAS1Q9NYS0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NKIRAS1Q9NYS0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NKIRAS1Q9NYS0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NKIRAS1Q9NYS0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKIRAS1Q9NYS0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKIRAS1Q9NYS0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NKIRAS1Q9NYS0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NKIRAS1Q9NYS0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms