Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA3

GOLGA6A, Golgin subfamily A member 6A, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6AQ9NYA3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6AQ9NYA3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6AQ9NYA3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6AQ9NYA3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6AQ9NYA3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6AQ9NYA3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6AQ9NYA3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6AQ9NYA3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6AQ9NYA3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6AQ9NYA3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6AQ9NYA3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6AQ9NYA3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6AQ9NYA3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6AQ9NYA3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6AQ9NYA3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6AQ9NYA3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA6AQ9NYA3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA6AQ9NYA3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA6AQ9NYA3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA6AQ9NYA3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA6AQ9NYA3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA6AQ9NYA3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA6AQ9NYA3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA6AQ9NYA3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOLGA6AQ9NYA3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOLGA6AQ9NYA3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOLGA6AQ9NYA3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOLGA6AQ9NYA3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOLGA6AQ9NYA3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOLGA6AQ9NYA3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GOLGA6AQ9NYA3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOLGA6AQ9NYA3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GOLGA6AQ9NYA3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6AQ9NYA3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms