Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX57

RAB20, Ras-related protein Rab-20, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20Q9NX57 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB20Q9NX57 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB20Q9NX57 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB20Q9NX57 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB20Q9NX57 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB20Q9NX57 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB20Q9NX57 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB20Q9NX57 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB20Q9NX57 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB20Q9NX57 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB20Q9NX57 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB20Q9NX57 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB20Q9NX57 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB20Q9NX57 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB20Q9NX57 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB20Q9NX57 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAB20Q9NX57 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAB20Q9NX57 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB20Q9NX57 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB20Q9NX57 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB20Q9NX57 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB20Q9NX57 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB20Q9NX57 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB20Q9NX57 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB20Q9NX57 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB20Q9NX57 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB20Q9NX57 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB20Q9NX57 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB20Q9NX57 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB20Q9NX57 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB20Q9NX57 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB20Q9NX57 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB20Q9NX57 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB20Q9NX57 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB20Q9NX57 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB20Q9NX57 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB20Q9NX57 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB20Q9NX57 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB20Q9NX57 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB20Q9NX57 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB20Q9NX57 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB20Q9NX57 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB20Q9NX57 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB20Q9NX57 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB20Q9NX57 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB20Q9NX57 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB20Q9NX57 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB20Q9NX57 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB20Q9NX57 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB20Q9NX57 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB20Q9NX57 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RAB20Q9NX57 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RAB20Q9NX57 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RAB20Q9NX57 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RAB20Q9NX57 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RAB20Q9NX57 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB20Q9NX57 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB20Q9NX57 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB20Q9NX57 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB20Q9NX57 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB20Q9NX57 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB20Q9NX57 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB20Q9NX57 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB20Q9NX57 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB20Q9NX57 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB20Q9NX57 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB20Q9NX57 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB20Q9NX57 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB20Q9NX57 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB20Q9NX57 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB20Q9NX57 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB20Q9NX57 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB20Q9NX57 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB20Q9NX57 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB20Q9NX57 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB20Q9NX57 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB20Q9NX57 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB20Q9NX57 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB20Q9NX57 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB20Q9NX57 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB20Q9NX57 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB20Q9NX57 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB20Q9NX57 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB20Q9NX57 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB20Q9NX57 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB20Q9NX57 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB20Q9NX57 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB20Q9NX57 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB20Q9NX57 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB20Q9NX57 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB20Q9NX57 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB20Q9NX57 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB20Q9NX57 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB20Q9NX57 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB20Q9NX57 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB20Q9NX57 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB20Q9NX57 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB20Q9NX57 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB20Q9NX57 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB20Q9NX57 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms