Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX07

TRNAU1AP, tRNA selenocysteine 1-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNAU1APQ9NX07 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRNAU1APQ9NX07 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRNAU1APQ9NX07 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRNAU1APQ9NX07 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRNAU1APQ9NX07 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRNAU1APQ9NX07 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRNAU1APQ9NX07 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRNAU1APQ9NX07 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRNAU1APQ9NX07 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRNAU1APQ9NX07 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRNAU1APQ9NX07 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRNAU1APQ9NX07 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRNAU1APQ9NX07 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRNAU1APQ9NX07 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRNAU1APQ9NX07 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRNAU1APQ9NX07 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRNAU1APQ9NX07 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRNAU1APQ9NX07 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRNAU1APQ9NX07 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRNAU1APQ9NX07 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRNAU1APQ9NX07 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRNAU1APQ9NX07 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRNAU1APQ9NX07 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRNAU1APQ9NX07 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRNAU1APQ9NX07 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRNAU1APQ9NX07 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRNAU1APQ9NX07 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRNAU1APQ9NX07 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRNAU1APQ9NX07 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRNAU1APQ9NX07 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRNAU1APQ9NX07 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRNAU1APQ9NX07 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRNAU1APQ9NX07 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRNAU1APQ9NX07 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRNAU1APQ9NX07 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRNAU1APQ9NX07 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRNAU1APQ9NX07 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRNAU1APQ9NX07 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRNAU1APQ9NX07 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRNAU1APQ9NX07 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRNAU1APQ9NX07 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRNAU1APQ9NX07 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRNAU1APQ9NX07 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRNAU1APQ9NX07 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRNAU1APQ9NX07 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRNAU1APQ9NX07 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRNAU1APQ9NX07 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRNAU1APQ9NX07 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRNAU1APQ9NX07 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRNAU1APQ9NX07 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRNAU1APQ9NX07 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRNAU1APQ9NX07 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRNAU1APQ9NX07 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRNAU1APQ9NX07 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRNAU1APQ9NX07 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRNAU1APQ9NX07 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRNAU1APQ9NX07 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRNAU1APQ9NX07 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRNAU1APQ9NX07 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRNAU1APQ9NX07 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRNAU1APQ9NX07 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRNAU1APQ9NX07 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRNAU1APQ9NX07 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRNAU1APQ9NX07 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRNAU1APQ9NX07 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRNAU1APQ9NX07 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRNAU1APQ9NX07 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRNAU1APQ9NX07 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRNAU1APQ9NX07 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRNAU1APQ9NX07 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRNAU1APQ9NX07 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRNAU1APQ9NX07 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRNAU1APQ9NX07 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRNAU1APQ9NX07 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRNAU1APQ9NX07 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRNAU1APQ9NX07 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRNAU1APQ9NX07 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRNAU1APQ9NX07 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRNAU1APQ9NX07 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRNAU1APQ9NX07 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRNAU1APQ9NX07 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRNAU1APQ9NX07 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRNAU1APQ9NX07 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRNAU1APQ9NX07 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRNAU1APQ9NX07 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRNAU1APQ9NX07 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRNAU1APQ9NX07 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRNAU1APQ9NX07 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRNAU1APQ9NX07 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRNAU1APQ9NX07 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRNAU1APQ9NX07 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRNAU1APQ9NX07 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRNAU1APQ9NX07 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRNAU1APQ9NX07 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRNAU1APQ9NX07 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRNAU1APQ9NX07 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRNAU1APQ9NX07 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRNAU1APQ9NX07 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRNAU1APQ9NX07 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRNAU1APQ9NX07 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms