Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLIMQ9NVW2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLIMQ9NVW2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RLIMQ9NVW2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RLIMQ9NVW2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RLIMQ9NVW2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RLIMQ9NVW2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RLIMQ9NVW2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RLIMQ9NVW2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RLIMQ9NVW2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RLIMQ9NVW2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RLIMQ9NVW2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RLIMQ9NVW2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RLIMQ9NVW2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RLIMQ9NVW2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RLIMQ9NVW2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RLIMQ9NVW2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RLIMQ9NVW2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RLIMQ9NVW2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RLIMQ9NVW2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RLIMQ9NVW2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RLIMQ9NVW2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RLIMQ9NVW2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RLIMQ9NVW2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RLIMQ9NVW2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RLIMQ9NVW2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RLIMQ9NVW2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RLIMQ9NVW2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RLIMQ9NVW2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RLIMQ9NVW2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RLIMQ9NVW2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RLIMQ9NVW2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RLIMQ9NVW2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RLIMQ9NVW2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RLIMQ9NVW2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RLIMQ9NVW2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RLIMQ9NVW2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RLIMQ9NVW2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RLIMQ9NVW2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RLIMQ9NVW2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RLIMQ9NVW2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RLIMQ9NVW2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RLIMQ9NVW2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RLIMQ9NVW2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RLIMQ9NVW2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RLIMQ9NVW2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RLIMQ9NVW2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms