Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVV0

TMEM38B, Trimeric intracellular cation channel type B, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM38BQ9NVV0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM38BQ9NVV0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM38BQ9NVV0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM38BQ9NVV0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM38BQ9NVV0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM38BQ9NVV0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM38BQ9NVV0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM38BQ9NVV0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM38BQ9NVV0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM38BQ9NVV0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM38BQ9NVV0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM38BQ9NVV0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM38BQ9NVV0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM38BQ9NVV0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM38BQ9NVV0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM38BQ9NVV0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM38BQ9NVV0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM38BQ9NVV0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM38BQ9NVV0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM38BQ9NVV0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM38BQ9NVV0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM38BQ9NVV0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM38BQ9NVV0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM38BQ9NVV0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM38BQ9NVV0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM38BQ9NVV0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM38BQ9NVV0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM38BQ9NVV0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM38BQ9NVV0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM38BQ9NVV0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM38BQ9NVV0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM38BQ9NVV0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM38BQ9NVV0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM38BQ9NVV0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM38BQ9NVV0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM38BQ9NVV0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM38BQ9NVV0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM38BQ9NVV0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM38BQ9NVV0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM38BQ9NVV0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM38BQ9NVV0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM38BQ9NVV0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM38BQ9NVV0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM38BQ9NVV0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM38BQ9NVV0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM38BQ9NVV0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM38BQ9NVV0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM38BQ9NVV0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM38BQ9NVV0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM38BQ9NVV0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM38BQ9NVV0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM38BQ9NVV0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM38BQ9NVV0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM38BQ9NVV0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM38BQ9NVV0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM38BQ9NVV0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM38BQ9NVV0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM38BQ9NVV0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM38BQ9NVV0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM38BQ9NVV0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM38BQ9NVV0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM38BQ9NVV0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM38BQ9NVV0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM38BQ9NVV0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM38BQ9NVV0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM38BQ9NVV0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM38BQ9NVV0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM38BQ9NVV0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM38BQ9NVV0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM38BQ9NVV0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM38BQ9NVV0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM38BQ9NVV0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM38BQ9NVV0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM38BQ9NVV0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM38BQ9NVV0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM38BQ9NVV0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM38BQ9NVV0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM38BQ9NVV0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM38BQ9NVV0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM38BQ9NVV0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM38BQ9NVV0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM38BQ9NVV0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM38BQ9NVV0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM38BQ9NVV0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM38BQ9NVV0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM38BQ9NVV0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM38BQ9NVV0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM38BQ9NVV0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM38BQ9NVV0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM38BQ9NVV0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM38BQ9NVV0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM38BQ9NVV0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM38BQ9NVV0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM38BQ9NVV0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM38BQ9NVV0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM38BQ9NVV0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM38BQ9NVV0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM38BQ9NVV0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM38BQ9NVV0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM38BQ9NVV0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms