Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH0

EXD2, Exonuclease 3'-5' domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXD2Q9NVH0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXD2Q9NVH0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXD2Q9NVH0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXD2Q9NVH0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXD2Q9NVH0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXD2Q9NVH0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXD2Q9NVH0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXD2Q9NVH0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXD2Q9NVH0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXD2Q9NVH0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXD2Q9NVH0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXD2Q9NVH0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXD2Q9NVH0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXD2Q9NVH0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXD2Q9NVH0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXD2Q9NVH0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXD2Q9NVH0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EXD2Q9NVH0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXD2Q9NVH0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXD2Q9NVH0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXD2Q9NVH0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXD2Q9NVH0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXD2Q9NVH0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXD2Q9NVH0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXD2Q9NVH0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXD2Q9NVH0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXD2Q9NVH0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXD2Q9NVH0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXD2Q9NVH0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXD2Q9NVH0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXD2Q9NVH0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXD2Q9NVH0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EXD2Q9NVH0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXD2Q9NVH0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXD2Q9NVH0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXD2Q9NVH0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXD2Q9NVH0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXD2Q9NVH0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXD2Q9NVH0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXD2Q9NVH0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXD2Q9NVH0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXD2Q9NVH0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXD2Q9NVH0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXD2Q9NVH0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXD2Q9NVH0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXD2Q9NVH0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXD2Q9NVH0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXD2Q9NVH0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXD2Q9NVH0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXD2Q9NVH0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXD2Q9NVH0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXD2Q9NVH0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXD2Q9NVH0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXD2Q9NVH0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXD2Q9NVH0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EXD2Q9NVH0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXD2Q9NVH0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXD2Q9NVH0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXD2Q9NVH0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXD2Q9NVH0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXD2Q9NVH0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXD2Q9NVH0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EXD2Q9NVH0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXD2Q9NVH0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXD2Q9NVH0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXD2Q9NVH0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXD2Q9NVH0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EXD2Q9NVH0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXD2Q9NVH0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXD2Q9NVH0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXD2Q9NVH0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXD2Q9NVH0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
EXD2Q9NVH0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
EXD2Q9NVH0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXD2Q9NVH0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXD2Q9NVH0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXD2Q9NVH0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXD2Q9NVH0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXD2Q9NVH0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXD2Q9NVH0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXD2Q9NVH0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXD2Q9NVH0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXD2Q9NVH0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXD2Q9NVH0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXD2Q9NVH0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXD2Q9NVH0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXD2Q9NVH0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXD2Q9NVH0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXD2Q9NVH0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXD2Q9NVH0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXD2Q9NVH0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXD2Q9NVH0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXD2Q9NVH0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXD2Q9NVH0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EXD2Q9NVH0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXD2Q9NVH0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXD2Q9NVH0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXD2Q9NVH0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXD2Q9NVH0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXD2Q9NVH0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms