Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTX5

ECHDC1, Ethylmalonyl-CoA decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1Q9NTX5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
ECHDC1Q9NTX5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ECHDC1Q9NTX5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ECHDC1Q9NTX5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ECHDC1Q9NTX5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ECHDC1Q9NTX5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ECHDC1Q9NTX5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ECHDC1Q9NTX5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ECHDC1Q9NTX5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ECHDC1Q9NTX5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ECHDC1Q9NTX5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ECHDC1Q9NTX5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ECHDC1Q9NTX5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ECHDC1Q9NTX5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ECHDC1Q9NTX5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ECHDC1Q9NTX5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ECHDC1Q9NTX5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ECHDC1Q9NTX5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ECHDC1Q9NTX5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ECHDC1Q9NTX5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ECHDC1Q9NTX5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ECHDC1Q9NTX5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ECHDC1Q9NTX5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ECHDC1Q9NTX5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
ECHDC1Q9NTX5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
ECHDC1Q9NTX5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ECHDC1Q9NTX5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ECHDC1Q9NTX5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ECHDC1Q9NTX5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ECHDC1Q9NTX5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ECHDC1Q9NTX5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ECHDC1Q9NTX5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ECHDC1Q9NTX5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ECHDC1Q9NTX5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ECHDC1Q9NTX5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ECHDC1Q9NTX5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ECHDC1Q9NTX5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ECHDC1Q9NTX5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ECHDC1Q9NTX5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ECHDC1Q9NTX5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ECHDC1Q9NTX5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ECHDC1Q9NTX5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ECHDC1Q9NTX5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ECHDC1Q9NTX5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ECHDC1Q9NTX5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ECHDC1Q9NTX5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ECHDC1Q9NTX5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ECHDC1Q9NTX5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ECHDC1Q9NTX5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ECHDC1Q9NTX5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ECHDC1Q9NTX5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ECHDC1Q9NTX5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ECHDC1Q9NTX5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ECHDC1Q9NTX5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ECHDC1Q9NTX5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ECHDC1Q9NTX5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ECHDC1Q9NTX5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ECHDC1Q9NTX5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ECHDC1Q9NTX5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ECHDC1Q9NTX5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ECHDC1Q9NTX5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ECHDC1Q9NTX5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ECHDC1Q9NTX5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ECHDC1Q9NTX5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ECHDC1Q9NTX5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ECHDC1Q9NTX5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ECHDC1Q9NTX5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ECHDC1Q9NTX5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ECHDC1Q9NTX5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ECHDC1Q9NTX5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ECHDC1Q9NTX5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ECHDC1Q9NTX5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ECHDC1Q9NTX5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ECHDC1Q9NTX5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ECHDC1Q9NTX5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ECHDC1Q9NTX5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ECHDC1Q9NTX5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ECHDC1Q9NTX5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ECHDC1Q9NTX5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ECHDC1Q9NTX5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ECHDC1Q9NTX5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ECHDC1Q9NTX5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ECHDC1Q9NTX5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ECHDC1Q9NTX5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ECHDC1Q9NTX5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ECHDC1Q9NTX5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ECHDC1Q9NTX5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ECHDC1Q9NTX5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ECHDC1Q9NTX5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ECHDC1Q9NTX5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ECHDC1Q9NTX5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ECHDC1Q9NTX5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ECHDC1Q9NTX5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ECHDC1Q9NTX5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ECHDC1Q9NTX5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ECHDC1Q9NTX5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ECHDC1Q9NTX5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ECHDC1Q9NTX5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ECHDC1Q9NTX5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ECHDC1Q9NTX5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.6 ms