Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKDREJQ9NTG1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKDREJQ9NTG1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKDREJQ9NTG1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKDREJQ9NTG1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PKDREJQ9NTG1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKDREJQ9NTG1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKDREJQ9NTG1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKDREJQ9NTG1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKDREJQ9NTG1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKDREJQ9NTG1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKDREJQ9NTG1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKDREJQ9NTG1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKDREJQ9NTG1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKDREJQ9NTG1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKDREJQ9NTG1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKDREJQ9NTG1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKDREJQ9NTG1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKDREJQ9NTG1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKDREJQ9NTG1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKDREJQ9NTG1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKDREJQ9NTG1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKDREJQ9NTG1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKDREJQ9NTG1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKDREJQ9NTG1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKDREJQ9NTG1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKDREJQ9NTG1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKDREJQ9NTG1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKDREJQ9NTG1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKDREJQ9NTG1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PKDREJQ9NTG1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKDREJQ9NTG1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PKDREJQ9NTG1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKDREJQ9NTG1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKDREJQ9NTG1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKDREJQ9NTG1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PKDREJQ9NTG1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PKDREJQ9NTG1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PKDREJQ9NTG1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PKDREJQ9NTG1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PKDREJQ9NTG1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PKDREJQ9NTG1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PKDREJQ9NTG1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PKDREJQ9NTG1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PKDREJQ9NTG1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PKDREJQ9NTG1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PKDREJQ9NTG1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PKDREJQ9NTG1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PKDREJQ9NTG1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKDREJQ9NTG1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKDREJQ9NTG1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKDREJQ9NTG1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKDREJQ9NTG1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKDREJQ9NTG1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKDREJQ9NTG1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKDREJQ9NTG1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PKDREJQ9NTG1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKDREJQ9NTG1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKDREJQ9NTG1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PKDREJQ9NTG1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKDREJQ9NTG1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKDREJQ9NTG1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKDREJQ9NTG1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKDREJQ9NTG1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKDREJQ9NTG1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKDREJQ9NTG1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKDREJQ9NTG1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKDREJQ9NTG1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PKDREJQ9NTG1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PKDREJQ9NTG1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKDREJQ9NTG1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKDREJQ9NTG1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKDREJQ9NTG1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKDREJQ9NTG1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PKDREJQ9NTG1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKDREJQ9NTG1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKDREJQ9NTG1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKDREJQ9NTG1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKDREJQ9NTG1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKDREJQ9NTG1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PKDREJQ9NTG1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKDREJQ9NTG1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PKDREJQ9NTG1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKDREJQ9NTG1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKDREJQ9NTG1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKDREJQ9NTG1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKDREJQ9NTG1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PKDREJQ9NTG1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms