Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD7

RXFP3, Relaxin-3 receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXFP3Q9NSD7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RXFP3Q9NSD7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RXFP3Q9NSD7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RXFP3Q9NSD7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RXFP3Q9NSD7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RXFP3Q9NSD7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RXFP3Q9NSD7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RXFP3Q9NSD7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RXFP3Q9NSD7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RXFP3Q9NSD7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RXFP3Q9NSD7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RXFP3Q9NSD7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RXFP3Q9NSD7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RXFP3Q9NSD7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RXFP3Q9NSD7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RXFP3Q9NSD7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RXFP3Q9NSD7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RXFP3Q9NSD7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RXFP3Q9NSD7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RXFP3Q9NSD7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RXFP3Q9NSD7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RXFP3Q9NSD7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RXFP3Q9NSD7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RXFP3Q9NSD7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RXFP3Q9NSD7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RXFP3Q9NSD7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RXFP3Q9NSD7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RXFP3Q9NSD7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RXFP3Q9NSD7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RXFP3Q9NSD7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RXFP3Q9NSD7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RXFP3Q9NSD7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RXFP3Q9NSD7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RXFP3Q9NSD7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RXFP3Q9NSD7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RXFP3Q9NSD7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RXFP3Q9NSD7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RXFP3Q9NSD7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RXFP3Q9NSD7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RXFP3Q9NSD7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RXFP3Q9NSD7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RXFP3Q9NSD7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RXFP3Q9NSD7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RXFP3Q9NSD7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RXFP3Q9NSD7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RXFP3Q9NSD7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RXFP3Q9NSD7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RXFP3Q9NSD7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RXFP3Q9NSD7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RXFP3Q9NSD7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RXFP3Q9NSD7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RXFP3Q9NSD7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RXFP3Q9NSD7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RXFP3Q9NSD7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RXFP3Q9NSD7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RXFP3Q9NSD7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RXFP3Q9NSD7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RXFP3Q9NSD7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RXFP3Q9NSD7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RXFP3Q9NSD7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RXFP3Q9NSD7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RXFP3Q9NSD7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RXFP3Q9NSD7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RXFP3Q9NSD7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RXFP3Q9NSD7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RXFP3Q9NSD7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RXFP3Q9NSD7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RXFP3Q9NSD7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RXFP3Q9NSD7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RXFP3Q9NSD7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RXFP3Q9NSD7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RXFP3Q9NSD7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RXFP3Q9NSD7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RXFP3Q9NSD7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RXFP3Q9NSD7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RXFP3Q9NSD7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RXFP3Q9NSD7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RXFP3Q9NSD7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RXFP3Q9NSD7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RXFP3Q9NSD7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RXFP3Q9NSD7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RXFP3Q9NSD7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RXFP3Q9NSD7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RXFP3Q9NSD7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RXFP3Q9NSD7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RXFP3Q9NSD7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RXFP3Q9NSD7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RXFP3Q9NSD7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RXFP3Q9NSD7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RXFP3Q9NSD7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RXFP3Q9NSD7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RXFP3Q9NSD7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RXFP3Q9NSD7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RXFP3Q9NSD7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RXFP3Q9NSD7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RXFP3Q9NSD7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RXFP3Q9NSD7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RXFP3Q9NSD7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RXFP3Q9NSD7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RXFP3Q9NSD7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms