Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM7SF3Q9NS93 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM7SF3Q9NS93 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM7SF3Q9NS93 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TM7SF3Q9NS93 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM7SF3Q9NS93 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM7SF3Q9NS93 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TM7SF3Q9NS93 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TM7SF3Q9NS93 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TM7SF3Q9NS93 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TM7SF3Q9NS93 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TM7SF3Q9NS93 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TM7SF3Q9NS93 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TM7SF3Q9NS93 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TM7SF3Q9NS93 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM7SF3Q9NS93 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM7SF3Q9NS93 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM7SF3Q9NS93 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM7SF3Q9NS93 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TM7SF3Q9NS93 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM7SF3Q9NS93 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM7SF3Q9NS93 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM7SF3Q9NS93 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM7SF3Q9NS93 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM7SF3Q9NS93 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM7SF3Q9NS93 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM7SF3Q9NS93 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TM7SF3Q9NS93 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM7SF3Q9NS93 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM7SF3Q9NS93 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM7SF3Q9NS93 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM7SF3Q9NS93 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM7SF3Q9NS93 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM7SF3Q9NS93 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM7SF3Q9NS93 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM7SF3Q9NS93 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM7SF3Q9NS93 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TM7SF3Q9NS93 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TM7SF3Q9NS93 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TM7SF3Q9NS93 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TM7SF3Q9NS93 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TM7SF3Q9NS93 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TM7SF3Q9NS93 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TM7SF3Q9NS93 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TM7SF3Q9NS93 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TM7SF3Q9NS93 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TM7SF3Q9NS93 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TM7SF3Q9NS93 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TM7SF3Q9NS93 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TM7SF3Q9NS93 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TM7SF3Q9NS93 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TM7SF3Q9NS93 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TM7SF3Q9NS93 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TM7SF3Q9NS93 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TM7SF3Q9NS93 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TM7SF3Q9NS93 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TM7SF3Q9NS93 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TM7SF3Q9NS93 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TM7SF3Q9NS93 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TM7SF3Q9NS93 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TM7SF3Q9NS93 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TM7SF3Q9NS93 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TM7SF3Q9NS93 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TM7SF3Q9NS93 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TM7SF3Q9NS93 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TM7SF3Q9NS93 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TM7SF3Q9NS93 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TM7SF3Q9NS93 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TM7SF3Q9NS93 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TM7SF3Q9NS93 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM7SF3Q9NS93 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TM7SF3Q9NS93 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM7SF3Q9NS93 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM7SF3Q9NS93 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM7SF3Q9NS93 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM7SF3Q9NS93 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM7SF3Q9NS93 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM7SF3Q9NS93 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TM7SF3Q9NS93 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TM7SF3Q9NS93 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TM7SF3Q9NS93 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TM7SF3Q9NS93 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TM7SF3Q9NS93 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TM7SF3Q9NS93 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TM7SF3Q9NS93 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TM7SF3Q9NS93 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TM7SF3Q9NS93 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TM7SF3Q9NS93 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TM7SF3Q9NS93 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TM7SF3Q9NS93 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TM7SF3Q9NS93 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TM7SF3Q9NS93 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TM7SF3Q9NS93 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TM7SF3Q9NS93 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM7SF3Q9NS93 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM7SF3Q9NS93 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM7SF3Q9NS93 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM7SF3Q9NS93 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM7SF3Q9NS93 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM7SF3Q9NS93 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms