Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRDM10Q9NQV6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRDM10Q9NQV6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PRDM10Q9NQV6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRDM10Q9NQV6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRDM10Q9NQV6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRDM10Q9NQV6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRDM10Q9NQV6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRDM10Q9NQV6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRDM10Q9NQV6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRDM10Q9NQV6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRDM10Q9NQV6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PRDM10Q9NQV6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRDM10Q9NQV6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRDM10Q9NQV6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRDM10Q9NQV6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRDM10Q9NQV6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRDM10Q9NQV6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRDM10Q9NQV6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PRDM10Q9NQV6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRDM10Q9NQV6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRDM10Q9NQV6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRDM10Q9NQV6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRDM10Q9NQV6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRDM10Q9NQV6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRDM10Q9NQV6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRDM10Q9NQV6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRDM10Q9NQV6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRDM10Q9NQV6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRDM10Q9NQV6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRDM10Q9NQV6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRDM10Q9NQV6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRDM10Q9NQV6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRDM10Q9NQV6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRDM10Q9NQV6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRDM10Q9NQV6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRDM10Q9NQV6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRDM10Q9NQV6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRDM10Q9NQV6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRDM10Q9NQV6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRDM10Q9NQV6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PRDM10Q9NQV6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRDM10Q9NQV6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRDM10Q9NQV6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRDM10Q9NQV6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRDM10Q9NQV6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRDM10Q9NQV6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRDM10Q9NQV6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
PRDM10Q9NQV6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRDM10Q9NQV6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PRDM10Q9NQV6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PRDM10Q9NQV6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRDM10Q9NQV6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRDM10Q9NQV6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRDM10Q9NQV6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRDM10Q9NQV6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRDM10Q9NQV6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRDM10Q9NQV6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRDM10Q9NQV6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRDM10Q9NQV6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRDM10Q9NQV6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRDM10Q9NQV6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRDM10Q9NQV6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRDM10Q9NQV6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRDM10Q9NQV6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRDM10Q9NQV6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRDM10Q9NQV6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRDM10Q9NQV6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRDM10Q9NQV6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRDM10Q9NQV6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRDM10Q9NQV6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRDM10Q9NQV6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRDM10Q9NQV6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PRDM10Q9NQV6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRDM10Q9NQV6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDM10Q9NQV6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDM10Q9NQV6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDM10Q9NQV6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDM10Q9NQV6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDM10Q9NQV6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDM10Q9NQV6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDM10Q9NQV6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDM10Q9NQV6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRDM10Q9NQV6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRDM10Q9NQV6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRDM10Q9NQV6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRDM10Q9NQV6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRDM10Q9NQV6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRDM10Q9NQV6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRDM10Q9NQV6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRDM10Q9NQV6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PRDM10Q9NQV6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PRDM10Q9NQV6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRDM10Q9NQV6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRDM10Q9NQV6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRDM10Q9NQV6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRDM10Q9NQV6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRDM10Q9NQV6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRDM10Q9NQV6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRDM10Q9NQV6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms