Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
XPNPEP3Q9NQH7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
XPNPEP3Q9NQH7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
XPNPEP3Q9NQH7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
XPNPEP3Q9NQH7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
XPNPEP3Q9NQH7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
XPNPEP3Q9NQH7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
XPNPEP3Q9NQH7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
XPNPEP3Q9NQH7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
XPNPEP3Q9NQH7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
XPNPEP3Q9NQH7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
XPNPEP3Q9NQH7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
XPNPEP3Q9NQH7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
XPNPEP3Q9NQH7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
XPNPEP3Q9NQH7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
XPNPEP3Q9NQH7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
XPNPEP3Q9NQH7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
XPNPEP3Q9NQH7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
XPNPEP3Q9NQH7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
XPNPEP3Q9NQH7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
XPNPEP3Q9NQH7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
XPNPEP3Q9NQH7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
XPNPEP3Q9NQH7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
XPNPEP3Q9NQH7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
XPNPEP3Q9NQH7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
XPNPEP3Q9NQH7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
XPNPEP3Q9NQH7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
XPNPEP3Q9NQH7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
XPNPEP3Q9NQH7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
XPNPEP3Q9NQH7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
XPNPEP3Q9NQH7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
XPNPEP3Q9NQH7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
XPNPEP3Q9NQH7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
XPNPEP3Q9NQH7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
XPNPEP3Q9NQH7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
XPNPEP3Q9NQH7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
XPNPEP3Q9NQH7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
XPNPEP3Q9NQH7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
XPNPEP3Q9NQH7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
XPNPEP3Q9NQH7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
XPNPEP3Q9NQH7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
XPNPEP3Q9NQH7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
XPNPEP3Q9NQH7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
XPNPEP3Q9NQH7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
XPNPEP3Q9NQH7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
XPNPEP3Q9NQH7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
XPNPEP3Q9NQH7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
XPNPEP3Q9NQH7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
XPNPEP3Q9NQH7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
XPNPEP3Q9NQH7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
XPNPEP3Q9NQH7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
XPNPEP3Q9NQH7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
XPNPEP3Q9NQH7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
XPNPEP3Q9NQH7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XPNPEP3Q9NQH7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XPNPEP3Q9NQH7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
XPNPEP3Q9NQH7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XPNPEP3Q9NQH7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
XPNPEP3Q9NQH7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XPNPEP3Q9NQH7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
XPNPEP3Q9NQH7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
XPNPEP3Q9NQH7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
XPNPEP3Q9NQH7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
XPNPEP3Q9NQH7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
XPNPEP3Q9NQH7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
XPNPEP3Q9NQH7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
XPNPEP3Q9NQH7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
XPNPEP3Q9NQH7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
XPNPEP3Q9NQH7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
XPNPEP3Q9NQH7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
XPNPEP3Q9NQH7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
XPNPEP3Q9NQH7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
XPNPEP3Q9NQH7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
XPNPEP3Q9NQH7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
XPNPEP3Q9NQH7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
XPNPEP3Q9NQH7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
XPNPEP3Q9NQH7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
XPNPEP3Q9NQH7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
XPNPEP3Q9NQH7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
XPNPEP3Q9NQH7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
XPNPEP3Q9NQH7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
XPNPEP3Q9NQH7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
XPNPEP3Q9NQH7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
XPNPEP3Q9NQH7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
XPNPEP3Q9NQH7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms