Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQE9

HINT3, Histidine triad nucleotide-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINT3Q9NQE9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HINT3Q9NQE9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HINT3Q9NQE9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HINT3Q9NQE9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HINT3Q9NQE9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HINT3Q9NQE9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HINT3Q9NQE9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HINT3Q9NQE9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HINT3Q9NQE9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HINT3Q9NQE9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HINT3Q9NQE9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HINT3Q9NQE9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HINT3Q9NQE9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HINT3Q9NQE9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HINT3Q9NQE9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HINT3Q9NQE9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HINT3Q9NQE9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HINT3Q9NQE9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HINT3Q9NQE9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HINT3Q9NQE9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HINT3Q9NQE9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HINT3Q9NQE9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HINT3Q9NQE9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HINT3Q9NQE9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HINT3Q9NQE9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HINT3Q9NQE9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HINT3Q9NQE9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HINT3Q9NQE9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HINT3Q9NQE9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HINT3Q9NQE9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HINT3Q9NQE9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HINT3Q9NQE9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HINT3Q9NQE9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HINT3Q9NQE9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HINT3Q9NQE9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HINT3Q9NQE9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HINT3Q9NQE9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HINT3Q9NQE9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HINT3Q9NQE9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HINT3Q9NQE9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HINT3Q9NQE9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HINT3Q9NQE9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HINT3Q9NQE9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HINT3Q9NQE9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HINT3Q9NQE9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HINT3Q9NQE9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HINT3Q9NQE9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms