Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIMMDC1Q9NPL8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIMMDC1Q9NPL8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TIMMDC1Q9NPL8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TIMMDC1Q9NPL8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TIMMDC1Q9NPL8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TIMMDC1Q9NPL8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TIMMDC1Q9NPL8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TIMMDC1Q9NPL8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TIMMDC1Q9NPL8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TIMMDC1Q9NPL8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TIMMDC1Q9NPL8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TIMMDC1Q9NPL8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TIMMDC1Q9NPL8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TIMMDC1Q9NPL8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TIMMDC1Q9NPL8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TIMMDC1Q9NPL8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TIMMDC1Q9NPL8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TIMMDC1Q9NPL8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TIMMDC1Q9NPL8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TIMMDC1Q9NPL8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TIMMDC1Q9NPL8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TIMMDC1Q9NPL8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TIMMDC1Q9NPL8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TIMMDC1Q9NPL8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TIMMDC1Q9NPL8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMMDC1Q9NPL8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMMDC1Q9NPL8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMMDC1Q9NPL8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMMDC1Q9NPL8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMMDC1Q9NPL8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMMDC1Q9NPL8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TIMMDC1Q9NPL8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TIMMDC1Q9NPL8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TIMMDC1Q9NPL8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMMDC1Q9NPL8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMMDC1Q9NPL8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMMDC1Q9NPL8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMMDC1Q9NPL8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMMDC1Q9NPL8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMMDC1Q9NPL8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TIMMDC1Q9NPL8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMMDC1Q9NPL8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMMDC1Q9NPL8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMMDC1Q9NPL8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMMDC1Q9NPL8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TIMMDC1Q9NPL8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMMDC1Q9NPL8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMMDC1Q9NPL8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMMDC1Q9NPL8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMMDC1Q9NPL8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMMDC1Q9NPL8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TIMMDC1Q9NPL8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMMDC1Q9NPL8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMMDC1Q9NPL8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMMDC1Q9NPL8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMMDC1Q9NPL8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMMDC1Q9NPL8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMMDC1Q9NPL8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMMDC1Q9NPL8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMMDC1Q9NPL8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMMDC1Q9NPL8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMMDC1Q9NPL8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMMDC1Q9NPL8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMMDC1Q9NPL8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIMMDC1Q9NPL8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIMMDC1Q9NPL8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIMMDC1Q9NPL8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TIMMDC1Q9NPL8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMMDC1Q9NPL8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMMDC1Q9NPL8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMMDC1Q9NPL8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMMDC1Q9NPL8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMMDC1Q9NPL8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMMDC1Q9NPL8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMMDC1Q9NPL8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMMDC1Q9NPL8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMMDC1Q9NPL8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMMDC1Q9NPL8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMMDC1Q9NPL8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMMDC1Q9NPL8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMMDC1Q9NPL8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMMDC1Q9NPL8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMMDC1Q9NPL8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMMDC1Q9NPL8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMMDC1Q9NPL8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMMDC1Q9NPL8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMMDC1Q9NPL8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMMDC1Q9NPL8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms